| 查看: 1667 | 回复: 5 | ||||
qchj2004金虫 (正式写手)
|
[交流]
构象搜索与能量优化有什么区别
|
| 我看计算方面的文献，总是对分子先进行构象搜索，再进行能量优化，不懂之处：构象搜索是计算各种构象的能量，选取最小值，能量优化也是选取最小值，他们二者到底有什么区别了，为什么不能一次进行完毕，非得按两次完成？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子模拟 |
» 猜你喜欢
314求调剂
已经有5人回复
-
314求调剂
已经有11人回复
-
还有化工二轮调剂的学校吗
已经有28人回复
-
材料化工总分334求调剂
已经有12人回复
-
296求调剂
已经有5人回复
-
297求调剂
已经有14人回复
-
考研二轮调剂
已经有5人回复
-
求机械专硕297第二批调剂
已经有5人回复
-
本科郑州大学，一志愿华东师范大学282求调剂
已经有25人回复
-
283求调剂
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- MS软件中Forcite结构优化时使用什么算法？
已经有4人回复
- gaussview中看到输出结果的能量是什么能量
已经有3人回复
- 对接的分子用于分子动力学模拟的问题
已经有12人回复
- 请问，分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢？
已经有7人回复
- 响应面和正交在配方优化中有什么区别
已经有13人回复
- 构象稳定性大小比较，谢谢！
已经有7人回复
- 二茂铁结构的不同画法，取哪个？
已经有11人回复
- 怎么消除虚频，细节
已经有10人回复
- 请教分子力学与分子动力学的区别
已经有14人回复
- 高斯计算中几种能量的区别
已经有8人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- 【求助】多目标决策、多目标优化、多目标规划的区别是什么？
已经有8人回复
- 【求助】什么叫淬火法优化
已经有11人回复
- 【转帖】一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
已经有109人回复
- 【sobereva个人文集】电子定域性的图形分析
已经有56人回复
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
qchj2004(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导！ 2014-07-22 13:46:13
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
qchj2004(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导！ 2014-07-22 13:46:13
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2014-07-22 13:30:38
qchj2004
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1493.4
- 散金: 332
- 帖子: 507
- 在线: 456.7小时
- 虫号: 849682
- 注册: 2009-09-16
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
3楼2014-07-22 17:09:12
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2014-07-22 17:16:18
ChemiAndy
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 40
- 应助: 52 (初中生)
- 金币: 2573.3
- 散金: 18
- 红花: 104
- 帖子: 590
- 在线: 553.8小时
- 虫号: 836907
- 注册: 2009-08-30
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
qchj2004: 金币+5, 讲的很清楚，谢谢 2014-07-23 17:22:40
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-07-26 16:46:10
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
qchj2004: 金币+5, 讲的很清楚，谢谢 2014-07-23 17:22:40
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-07-26 16:46:10
|
举个例子你就明白了，六元烷烃环有船式和椅式两种构型，你去做能量优化的话，最终得到船式还是椅式，取决于你输入进去的初始构型更靠近哪个。所以能量优化只能给出你一个优化好的结构，至于是不是还存在其它构象，它回答不了。而构象搜索可以帮你发现不同的构型，比如，一搜，发现了有船式和椅式两种。那么，这两种构象的能量差多少，哪个更低呢？这时候需要对这种两种构型分别进行结构优化，计算出其势能，然后才能 进行比较。 至于这个过程为什么不能一次进行完毕，是因为你不了解构想搜索的方法。构象搜索一般使用分子动力学或者蒙特卡洛等方法进行随即搜索，所搜到的构象并不处在能量最低的构型上，必须提取出来，再做一个能量优化。 |
5楼2014-07-23 04:52:21
xzh410512206
银虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 457.2
- 散金: 10
- 帖子: 127
- 在线: 75.4小时
- 虫号: 2630841
- 注册: 2013-09-02
- 专业: 应用有机化学
6楼2015-06-06 09:15:03
