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L-木木

新虫 (初入文坛)

[求助] blast本地过程出错 已有1人参与

我下载了htgs的一个数据库,解压后出现了好多文件(如图),我用了htgs.00.nsq,复制到bin文件夹里面,去了扩展名,先输入formatdb -i seqin -p F,出现了htgs.nin,在输入blastall -p blastx -i seqin -d htgs -o out.txt,却显示如图。求指点我哪里做错了,正确的步骤是怎样的,谢谢!

blast本地过程出错
htgs


blast本地过程出错-1
23.jpg


blast本地过程出错-2
IMG_0892.JPG
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steler_ly

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-07-21 08:25:25
L-木木: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-08-08 23:08:46
你的本地库不用格式化,你下载的是可以直接比对的库。检查下你是否已经把数据库都下载了。
2楼2014-07-21 06:33:09
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L-木木

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by steler_ly at 2014-07-21 06:33:09
你的本地库不用格式化,你下载的是可以直接比对的库。检查下你是否已经把数据库都下载了。

第一张图是我下载了htgs数据库以后,进行解压得到的所有文件。这样算都下载么?
我需要把哪些复制到bin文件夹里面呢?
3楼2014-07-21 11:11:50
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