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堆肥中DNA的提取
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swach
铁虫
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性别:
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专业: 污染控制化学
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堆肥中DNA的提取
各位大侠,有没有做过堆肥或是垃圾中基因组提取的。现在要用高通量测序的方法来测垃圾填埋场中微生物群落多样性,对于填埋场样品的基因组的提取,大家有什么建议?可以尽可能全面的反应填埋场的微生物多样性。还有就是我们试过用omega的土壤提取试剂盒提取填埋场样品的基因组,经过测试,浓度和纯度都远达不到测序公司的要求。关于基因组的提取,大家有什么好的建议吗?是对样品先进行先处理,然后再按照试剂盒的步骤提基因组,那应该做什么样的处理?或者是对提取之后的基因组进行进一步纯化,那又应该用什么样的纯化方法呢?不胜感激!!!!
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1楼
2014-07-11 16:51:04
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biolinker
金虫
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虫号: 3312930
注册: 2014-07-08
性别:
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专业: 环境微生物学
可以查相关文献,看别人是怎么处理的,用的是什么试剂盒。
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7楼
2014-07-16 16:30:46
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pzx1004
★
swach(金币+1): 谢谢参与
祝福
[ 发自小木虫客户端 ]
2楼
2014-07-11 16:51:18
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wrnwrn
木虫
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在线: 79.7小时
虫号: 3339820
注册: 2014-07-26
专业: 生物化学
对于腐殖质含量高的土样, 很多DNA提取方法或者试剂盒都力不从心, 试试这种方法, 应该有帮助:
http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10529-014-1591-5
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8楼
2014-07-27 14:22:06
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thug
新虫
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虫号: 4524960
注册: 2016-03-20
专业: 大气环境与全球气候变化
请问您后来结果怎么样了,虽然已经4年了,不知道还有人回答我么
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10楼
2018-07-11 12:24:13
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