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swach

铁虫 (小有名气)

[求助] 堆肥中DNA的提取

各位大侠,有没有做过堆肥或是垃圾中基因组提取的。现在要用高通量测序的方法来测垃圾填埋场中微生物群落多样性,对于填埋场样品的基因组的提取,大家有什么建议?可以尽可能全面的反应填埋场的微生物多样性。还有就是我们试过用omega的土壤提取试剂盒提取填埋场样品的基因组,经过测试,浓度和纯度都远达不到测序公司的要求。关于基因组的提取,大家有什么好的建议吗?是对样品先进行先处理,然后再按照试剂盒的步骤提基因组,那应该做什么样的处理?或者是对提取之后的基因组进行进一步纯化,那又应该用什么样的纯化方法呢?不胜感激!!!!
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[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-07-11 16:51:18
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swach(金币+1): 谢谢参与
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3楼2014-07-11 16:57:49
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4楼2014-07-11 17:00:18
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5楼2014-07-11 17:00:40
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6楼2014-07-11 17:01:31
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biolinker

金虫 (小有名气)

可以查相关文献,看别人是怎么处理的,用的是什么试剂盒。
7楼2014-07-16 16:30:46
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wrnwrn

木虫 (著名写手)

对于腐殖质含量高的土样, 很多DNA提取方法或者试剂盒都力不从心, 试试这种方法, 应该有帮助:
http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10529-014-1591-5
8楼2014-07-27 14:22:06
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wrnwrn

木虫 (著名写手)

9楼2014-07-27 20:48:26
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thug

新虫 (小有名气)

请问您后来结果怎么样了,虽然已经4年了,不知道还有人回答我么

发自小木虫Android客户端
10楼2018-07-11 12:24:13
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