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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xhuama

木虫 (小有名气)

[求助] 为什么用material studio计算构象收索的时候会出现下面的情况啊

用material studio 的conformer计算二螺吲哚的结构中构象旋转的能量,其二面角为两个吲哚环之间的旋转位阻。如果直接选择如图上附件1里面的二面角,
用的方法是systematic grid scan, 用的算法是campass,构象优化用smart。
其得到的结果如下:

ERROR: Searching for conformers
Structure contains ring torsions but no ring closure bonds.   Ring closure bonds are required to generate conformations of rings.

当我选择其中ring closure bond 时(如附件2),得到的结果却是如下:

ERROR: Searching for conformers
There are no usable torsions defined on the reference structure.

大家能不能帮我看看问题出在哪里啊?

为什么用material studio计算构象收索的时候会出现下面的情况啊
twist angle.jpg


为什么用material studio计算构象收索的时候会出现下面的情况啊-1
flexible one bond marked in green.jpg
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porouspolymer
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随沙飞扬

金虫 (正式写手)

您好  您能教我一下怎么计算二面角与能量之间的关系吗

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-06-05 07:46:37
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