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zpawl

铜虫 (小有名气)

[求助] material studio 计算氧气分子 已有3人参与

怎么在castep里构建O2分子呢?
我想计算O的化学势,所以想先计算O2的能量,用计算O2的total energy 除以2得到O的化学势,不知这样可以吗?
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雨轩36

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zpawl: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-04-02 21:53:33
1、先构建一个3D Atomistic文件(即构建一个3D物件视窗);2、在Build——>Crystals——>Build Crystals,这样就构建出了一个立方晶格空间。这个你肯定会。3、Build——>Add Atoms——>选择O原子,在把xyz坐标改为0.5、0.5、0.5,这样就在立方晶格中央构建出了一个O原子,你再用添加原子的笔在那个O原子上加上去一个O原子,就构建出了可以计算氧分子能量的模型。4、单独计算O原子的话,不再添加第二个O原子就行。
8楼2014-04-01 18:40:22
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-24 17:09:32
构建一个15x15.5x16 box 把O2放进去 结构优化然后单点能计算即可
可以
2楼2014-03-21 13:08:12
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-24 17:09:44
zpawl: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-03-26 12:39:56
引用回帖:
3楼: Originally posted by zpawl at 2014-03-21 13:36:07
为什么要建15*15.5*16的格子呢?
另外怎么把O2放进去的,具体操作不太会。。。
另外氧分子的键长是0.1209nm吗?
不优化结构直接算能量不行吗?...

破坏对称性 不破坏也行  两者均可
自己看ms的help文档
是的
不行
4楼2014-03-21 14:13:10
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普通回帖

zpawl

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-21 13:08:12
构建一个15x15.5x16 box 把O2放进去 结构优化然后单点能计算即可
可以

为什么要建15*15.5*16的格子呢?
另外怎么把O2放进去的,具体操作不太会。。。
另外氧分子的键长是0.1209nm吗?
不优化结构直接算能量不行吗?
3楼2014-03-21 13:36:07
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yellow622

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+1, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-24 17:09:54
建立一个10x10x10的立方体晶格把一个氧原子放进去,然后优化一下再计算能量就可以了
5楼2014-03-22 08:58:31
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雨轩36

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

解决了没,没有的话我再给你说具体步骤。
6楼2014-03-30 16:04:34
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zpawl

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 雨轩36 at 2014-03-30 16:04:34
解决了没,没有的话我再给你说具体步骤。

您可以具体说一下,我检查下自己做的对不对
7楼2014-03-31 21:27:13
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zpawl

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 雨轩36 at 2014-04-01 18:40:22
1、先构建一个3D Atomistic文件(即构建一个3D物件视窗);2、在Build——>Crystals——>Build Crystals,这样就构建出了一个立方晶格空间。这个你肯定会。3、Build——>Add Atoms——>选择O原子,在把 ...

十分感谢,我之前就是用这种方法计算的单个氧原子。
另外问个问题,构建氧分子的时候,您说在原来O原子上直接用笔再添加一个O原子,这样子的话键长能保证是氧分子的键长吗?不用自己设置吗?一般设置好,最后运行的时候,系统会问计算是按对称性计算还是用P1计算?我应该选哪个呢?
9楼2014-04-02 21:52:48
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雨轩36

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zpawl: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-04-04 08:24:04
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:39:37
要设置,可以根据经验、文献,你上面那个也可以,用对称性。
10楼2014-04-03 23:38:43
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