24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3002  |  回复: 7

wtt880615

木虫 (小有名气)

[求助] 关于material studio的问题

大家好,我有两个问题:
一:我想问一下为什么我在MS中建周期性结构时,在外面的分子会自动多很多键?如下图。
二:怎样建周期性的构型?我知道一种方法是在MS里找最小重复单元,然后把每个unicell边界上的键都连起来,但是总觉得这种方法只适合结构比较有序对称性较高的。
谢谢大家~
关于material studio的问题
123.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fegg7502: 金币+1, 3ks,, 2013-08-21 11:59:33
问题一:这正是系统周期性的表现;
问题二:对于晶体而言,晶胞本身就是周期性的;构建超晶胞可以让待研究体系更大,同时满足周期性。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2013-08-20 22:53:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtt880615

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-08-20 22:53:43
问题一:这正是系统周期性的表现;
问题二:对于晶体而言,晶胞本身就是周期性的;构建超晶胞可以让待研究体系更大,同时满足周期性。

你看一下图上的碳,连了很多键,周期性的也不能超过四个吧?
第二个问题,我想问的是怎么建构型,我现有的结构也不是晶体,只是在高斯中画的分子。
3楼2013-08-20 23:07:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
怎样建周期性的构型? 建超胞
快乐吧
4楼2013-08-20 23:28:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-21 11:59:46
wtt880615: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 我知道怎么解决了,非常感谢你的耐心回答。 2013-08-21 18:47:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by wtt880615 at 2013-08-20 23:07:12
你看一下图上的碳,连了很多键,周期性的也不能超过四个吧?
第二个问题,我想问的是怎么建构型,我现有的结构也不是晶体,只是在高斯中画的分子。...

其一,在build-bond中设置一下,目前的情况应该是系统自动计算的;
其二,如果该分子有晶体结构,则查找对应的晶体结构,晶胞自然是周期性的;如果只是孤立的分子,计算模块需要体系是周期性的,则自己建一个P1的晶格,把分子放进晶格中。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
5楼2013-08-20 23:38:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtt880615

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-08-20 23:38:09
其一,在build-bond中设置一下,目前的情况应该是系统自动计算的;
其二,如果该分子有晶体结构,则查找对应的晶体结构,晶胞自然是周期性的;如果只是孤立的分子,计算模块需要体系是周期性的,则自己建一个P1的 ...

不好意思,能不能再具体点,到底如何设置?谢谢
关于material studio的问题-1
11.png

6楼2013-08-21 09:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)


fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-21 11:59:57
引用回帖:
6楼: Originally posted by wtt880615 at 2013-08-21 09:25:56
不好意思,能不能再具体点,到底如何设置?谢谢

11.png
...

Options的下栏的三个选项,勾选一个,然后calculate。
其实一般,不会出现这种问题的。不知道你的分子是怎么来的,看你一楼的图,是有晶格的。如果你是要用MS做计算,就在MS画分子,画好的分子一般不会出现成键错误这种问题。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
7楼2013-08-21 11:11:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtt880615

木虫 (小有名气)


fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-21 12:00:16
引用回帖:
7楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-08-21 11:11:31
Options的下栏的三个选项,勾选一个,然后calculate。
其实一般,不会出现这种问题的。不知道你的分子是怎么来的,看你一楼的图,是有晶格的。如果你是要用MS做计算,就在MS画分子,画好的分子一般不会出现成键错 ...

我的分子结构是自己画的,在高斯里优化完,想拿来建周期性的结构的,图中的晶格是我自己build crystal自己加的,加晶格时,如果晶格比分子本身大,就没问题。如果加的晶格比分子小,就会出现一楼图中的问题(多出来很多键)
我刚刚按你说的方法calculate后还是不行。
8楼2013-08-21 11:21:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wtt880615 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +9 让我上岸吧阿西 2026-04-09 11/550 2026-04-10 19:18 by 靖jing
[考研] 290求调剂 +3 luoziheng 2026-04-10 3/150 2026-04-10 19:02 by xulei3024
[考研] 332求调剂 +12 蕉蕉123 2026-04-10 12/600 2026-04-10 19:01 by hmn_wj
[考研] 电子信息279求调剂,有书读就行 +4 wwwooden 2026-04-08 7/350 2026-04-10 11:34 by wwwooden
[考研] 化学工程调剂289 +42 yang婷 2026-04-07 48/2400 2026-04-10 09:34 by 690616278
[考研] 293求调剂 +5 勇远库爱314 2026-04-08 5/250 2026-04-10 08:46 by vgtyfty
[考研] 085600材料与化工301分求调剂院校 +33 刺痛jk 2026-04-06 34/1700 2026-04-09 18:31 by hy861222
[考研] 一志愿厦大生物学332求调剂 +10 池池池池池池 2026-04-08 10/500 2026-04-09 17:10 by 独醉梦孤城
[考研] 材料调剂 +14 一样YWY 2026-04-05 15/750 2026-04-09 13:36 by 故人??
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +17 熊二想上岸 2026-04-04 18/900 2026-04-09 09:13 by leyan1127
[考研] 求助071001调剂!!! +7 黄守松 2026-04-05 8/400 2026-04-09 09:07 by 徐良白眉大侠
[考研] 327求调剂 +10 Xxjc1107. 2026-04-06 11/550 2026-04-09 01:21 by lature00
[考研] 318求调剂 +13 ykyhsa 2026-04-05 15/750 2026-04-08 21:37 by wj165256
[考研] 266调剂 +8 daya sun 2026-04-07 9/450 2026-04-08 20:27 by yutian743
[考研] 312求调剂 +4 Say Never 2026-04-04 4/200 2026-04-08 08:41 by barlinike
[考研] 286求调剂 +20 Faune 2026-04-06 20/1000 2026-04-07 11:33 by 诗与自由
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +11 大火山小火山 2026-04-05 11/550 2026-04-06 22:55 by yunlongyang
[考研] 08专硕275调剂 +5 AaAa7420 2026-04-05 5/250 2026-04-05 18:01 by jkddd
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +6 ioodiiij 2026-04-04 6/300 2026-04-05 10:09 by guoweigw
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
信息提示
请填处理意见