24小时热门版块排行榜    

查看: 2889  |  回复: 7

wtt880615

木虫 (小有名气)

[求助] 关于material studio的问题

大家好,我有两个问题:
一:我想问一下为什么我在MS中建周期性结构时,在外面的分子会自动多很多键?如下图。
二:怎样建周期性的构型?我知道一种方法是在MS里找最小重复单元,然后把每个unicell边界上的键都连起来,但是总觉得这种方法只适合结构比较有序对称性较高的。
谢谢大家~
关于material studio的问题
123.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fegg7502: 金币+1, 3ks,, 2013-08-21 11:59:33
问题一:这正是系统周期性的表现;
问题二:对于晶体而言,晶胞本身就是周期性的;构建超晶胞可以让待研究体系更大,同时满足周期性。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2013-08-20 22:53:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtt880615

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-08-20 22:53:43
问题一:这正是系统周期性的表现;
问题二:对于晶体而言,晶胞本身就是周期性的;构建超晶胞可以让待研究体系更大,同时满足周期性。

你看一下图上的碳,连了很多键,周期性的也不能超过四个吧?
第二个问题,我想问的是怎么建构型,我现有的结构也不是晶体,只是在高斯中画的分子。
3楼2013-08-20 23:07:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
怎样建周期性的构型? 建超胞
快乐吧
4楼2013-08-20 23:28:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-21 11:59:46
wtt880615: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 我知道怎么解决了,非常感谢你的耐心回答。 2013-08-21 18:47:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by wtt880615 at 2013-08-20 23:07:12
你看一下图上的碳,连了很多键,周期性的也不能超过四个吧?
第二个问题,我想问的是怎么建构型,我现有的结构也不是晶体,只是在高斯中画的分子。...

其一,在build-bond中设置一下,目前的情况应该是系统自动计算的;
其二,如果该分子有晶体结构,则查找对应的晶体结构,晶胞自然是周期性的;如果只是孤立的分子,计算模块需要体系是周期性的,则自己建一个P1的晶格,把分子放进晶格中。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
5楼2013-08-20 23:38:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtt880615

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-08-20 23:38:09
其一,在build-bond中设置一下,目前的情况应该是系统自动计算的;
其二,如果该分子有晶体结构,则查找对应的晶体结构,晶胞自然是周期性的;如果只是孤立的分子,计算模块需要体系是周期性的,则自己建一个P1的 ...

不好意思,能不能再具体点,到底如何设置?谢谢
关于material studio的问题-1
11.png

6楼2013-08-21 09:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)


fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-21 11:59:57
引用回帖:
6楼: Originally posted by wtt880615 at 2013-08-21 09:25:56
不好意思,能不能再具体点,到底如何设置?谢谢

11.png
...

Options的下栏的三个选项,勾选一个,然后calculate。
其实一般,不会出现这种问题的。不知道你的分子是怎么来的,看你一楼的图,是有晶格的。如果你是要用MS做计算,就在MS画分子,画好的分子一般不会出现成键错误这种问题。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
7楼2013-08-21 11:11:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtt880615

木虫 (小有名气)


fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-21 12:00:16
引用回帖:
7楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-08-21 11:11:31
Options的下栏的三个选项,勾选一个,然后calculate。
其实一般,不会出现这种问题的。不知道你的分子是怎么来的,看你一楼的图,是有晶格的。如果你是要用MS做计算,就在MS画分子,画好的分子一般不会出现成键错 ...

我的分子结构是自己画的,在高斯里优化完,想拿来建周期性的结构的,图中的晶格是我自己build crystal自己加的,加晶格时,如果晶格比分子本身大,就没问题。如果加的晶格比分子小,就会出现一楼图中的问题(多出来很多键)
我刚刚按你说的方法calculate后还是不行。
8楼2013-08-21 11:21:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wtt880615 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 03:05 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:52 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 4/200 2026-02-08 02:45 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:27 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:25 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:12 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:07 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:05 by vs90ilomwc
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 01:46 by vs90ilomwc
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:45 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:32 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:26 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:12 by vs90ilomwc
[教师之家] 有院领导为了换新车,用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 同年申请2项不同项目,第1个项目里不写第2个项目的信息,可以吗 +4 hitsdu 2026-02-06 4/200 2026-02-07 13:07 by jurkat.1640
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[硕博家园] 博士延得我,科研能力直往上蹿 +7 偏振片 2026-02-02 7/350 2026-02-04 17:36 by 陈氏帝国
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
请填处理意见