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tornadozyb

捐助贵宾 (正式写手)

高分子自组装教教主

[求助] 如何用ms,1.求一个分子链的整体的体积,2.支链的体积，3.调整到最低能量的分子构象？

如题，如何用material studio
1.求一个分子链的整体的体积,
2.支链的体积，
3.调整到最低能量的分子构象？
求帮助，谢了
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1楼 2012-07-25 19:06:32
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yadong80

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-27 12:56:58
tornadozyb: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢，那这个情况下的电子密度用哪个modules？ 2012-08-02 17:56:41
你准备以什么半径来定义分子体积？原子的范德华半径？
你可以在tool中看看atom volumes & surfaces，如果确认了半径，就可以做出isoface，那么isoface所包围的体积可以在analysis中看到，或者properties explorer中的isoface选项里也会有数值。支链体积可以参照获取，只不过需要先选择支链原子。
最低能量的分子构象得通过分子动力学，譬如forcite plus中的aneal和qunch都可以对构想进行研究，或者直接用conformer，利用类似MC的方法研究低能构想。
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2楼2012-07-26 23:12:13
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安德

铁杆木虫 (著名写手)

** *_** ___ ***_ * _*

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+1, 谢谢回帖交流。 2012-07-27 12:57:23
tornadozyb: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-08-02 17:56:55
能量最低的分子构想也可以考虑用第一性原理来计算，比如DMol
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That'sit! Justdoit!
3楼2012-07-27 08:39:57
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zhoucb
4楼2012-07-27 09:16:16
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dujunhui

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+1, 谢谢回帖交流。 2012-07-28 18:15:12
引用回帖:
3楼: Originally posted by 安德 at 2012-07-27 08:39:57
能量最低的分子构想也可以考虑用第一性原理来计算，比如DMol

这么多原子，用第一性原理跑恐怕比较吃力吧？
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5楼2012-07-28 10:50:42
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安德

铁杆木虫 (著名写手)

** *_** ___ ***_ * _*

【答案】应助回帖

得看你机器配置了，还有你能忍受时间长度的极限
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That'sit! Justdoit!
6楼2012-07-28 20:50:32
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2120171342

新虫 (初入文坛)
请问你算出来了吗
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7楼2018-11-12 10:18:50
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