24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2453  |  回复: 17

shangshui123

新虫 (职业作家)

[求助] 如何在linux系统服务器中查看material studio计算结果 已有2人参与

笔记本坏了,平常计算任务是用笔记本远程提交到linux系统服务器上的,想从服务器上查看之前计算结果,不知怎么查,包括全部结果,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖! 2014-04-12 19:31:20
...../Accelrys/MaterialsStudioX0/etc/Gateway/root_default/dsd/jobs/任务的PID/
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-04-11 13:27:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

shangshui123

新虫 (职业作家)

我都看过,但没有说这个的,谢谢你
2楼2014-04-11 12:47:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shangshui123

新虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-11 13:27:25
...../Accelrys/MaterialsStudioX0/etc/Gateway/root_default/dsd/jobs/任务的PID/

这个我知道但里边只有文本信息,怎么查看图形呢,之前都没有保存,有没有啥办法呢
4楼2014-04-11 17:20:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖! 2014-04-12 19:31:29
引用回帖:
4楼: Originally posted by shangshui123 at 2014-04-11 17:20:30
这个我知道但里边只有文本信息,怎么查看图形呢,之前都没有保存,有没有啥办法呢...

这个直接看没办法,如果你用的是castep或者dmol3(这两种输出文件我还算了解,也许onetep也行),那么可以将*.castep以及*.outmol中的lattice vector和atomic position拷贝下来,改写成cif格式或是其他格式,再通过MS导回。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
5楼2014-04-11 17:33:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shangshui123

新虫 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-11 17:33:54
这个直接看没办法,如果你用的是castep或者dmol3(这两种输出文件我还算了解,也许onetep也行),那么可以将*.castep以及*.outmol中的lattice vector和atomic position拷贝下来,改写成cif格式或是其他格式,再通过 ...

这个怎么导呢,另外找不到lattice vector,只找到了最后的原子坐标,能不能以一个图看看呢,就是保存的文件内容
6楼2014-04-11 20:09:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
shangshui123(fzx2008代发): 金币+3 2014-04-12 19:32:12
比如:       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    5.878494          alpha =  106.400158
                    b =    5.878494          beta  =  106.400158
                    c =    5.878494          gamma =  115.805137

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  O            1         0.511200   1.325000   1.186200   x
            x  O            2         1.138800   0.325000  -0.186200   x
            x  O            3         2.075000   0.388800   1.313800   x
            x  O            4         0.075000   1.761200  -0.313800   x
            x  O            5         0.611200  -0.075000  -0.313800   x
            x  O            6         0.238800   0.925000   1.313800   x
            x  O            7         1.675000   0.861200   2.186200   x
            x  O            8        -1.325000  -0.511200  -1.186200   x
            x  V            1         0.500000   1.500000   1.000000   x
            x  V            2         2.250000   0.750000   1.500000   x
            x  Yb           1        -0.250000   1.250000   0.500000   x
            x  Yb           2         2.000000   1.000000   2.000000   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

靠这信息转格式吧,其他也没啥办法了。把这些内容改写成pdb或是其他的格式。另外,计算成功后产生的check文件有可能其他程序能够打开,但是怎么处理我不了解。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2014-04-11 21:18:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shangshui123

新虫 (职业作家)

我就是把原子的坐标全部复制后保存为cif格式,但是导不出来,为什么呢,您导过吗,我的不是晶胞,所以就没有晶向参数
8楼2014-04-11 22:34:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:31:20
引用回帖:
8楼: Originally posted by shangshui123 at 2014-04-11 22:34:09
我就是把原子的坐标全部复制后保存为cif格式,但是导不出来,为什么呢,您导过吗,我的不是晶胞,所以就没有晶向参数

不是晶胞?你计算的模块是Dmol3 ,那么把原子坐标写成*.xyz或者*.pdb会比较合适。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
9楼2014-04-12 13:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shangshui123

新虫 (职业作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-12 13:03:56
不是晶胞?你计算的模块是Dmol3 ,那么把原子坐标写成*.xyz或者*.pdb会比较合适。...

我这就是XYZ,类似这个  
                      Input Coordinates (Angstroms)
          ----------------------------------------------------------------------
               ATOM               X                   Y                   Z
            1    C             2.693834           -1.253686            0.174196
            2    C             2.262810           -2.532202            0.899784
            3    O             4.012905           -0.906854            0.608575
            4    O             2.888802           -2.865661            1.906916
            5    C            -0.072338           -4.632982           -1.438005
            6    C            -0.176595           -5.933733           -0.638884
            7    C             1.143986           -6.669425           -0.546591
            8    C             2.363025           -6.029560           -0.827521
            9    C             2.416480           -4.609433           -1.343502
10楼2014-04-12 19:04:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shangshui123 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂!生物与医药专硕 +5 逆转陆先生 2026-04-01 6/300 2026-04-06 12:49 by lys0704
[考研] 求调剂 +11 xzghyuj 2026-04-04 11/550 2026-04-06 11:49 by lijunpoly
[考研] 320分人工智能调剂 +8 振—TZ 2026-04-03 8/400 2026-04-05 22:33 by 范式思维
[考研] 312求调剂 +3 Say Never 2026-04-04 3/150 2026-04-05 11:19 by guoweigw
[考研] 359求调剂22408 +3 123456789qw 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:09 by zhq0425
[考研] 353求调剂 +10 MayUxw1 2026-04-03 10/500 2026-04-05 09:23 by 无际的草原
[考研] 296材料专硕求调剂 +21 202451007219 2026-04-02 22/1100 2026-04-04 21:48 by hemengdong
[考研] 292求调剂 +11 2022080213 2026-04-04 13/650 2026-04-04 18:38 by macy2011
[考研] 311求调剂 +20 zchqwer 2026-04-01 22/1100 2026-04-03 22:09 by lglzsd
[考研] 303求调剂 +9 DLkz1314. 2026-03-30 9/450 2026-04-03 18:34 by ls刘帅
[考研] 求调剂不挑专业 +3 xrh030412 2026-04-01 3/150 2026-04-03 14:40 by 氮气气气
[考研] 085501一志愿天工大,机械专硕求调剂,跨材料 +3 33上 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:08 by 1753564080
[考研] 数一英一285求调剂 +7 AZMK 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:03 by ms629
[考研] 309求调剂 +14 呆菇不是戴夫 2026-04-02 14/700 2026-04-03 09:42 by 蓝云思雨
[考研] 302求调剂 +9 zyx上岸! 2026-04-02 9/450 2026-04-02 23:07 by 马儿快快地跑
[考研] 交通运输考试264分求工科调剂 +4 jike777 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:53 by zllcz
[考研] 282求调剂 +13 呼吸都是减肥 2026-04-01 13/650 2026-04-02 14:10 by baoball
[考研] 材料专硕322分 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 11/550 2026-04-02 10:52 by lnilvy
[考研] 材料调剂 +10 Eujd1 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:23 by ivanqyq
[考研] 一志愿浙江大学工科动力工程370,数一121,专业课135,现在能去哪里 +3 080700调剂 2026-03-30 4/200 2026-03-31 12:00 by KLMY666
信息提示
请填处理意见