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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » PCM模型求助
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gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy

[求助] PCM模型求助 已有4人参与

计算用PCM模型，溶剂用乙酸酐，但Gaussian 09默认的溶剂里面没有乙酸酐，因此照说明书里的进行自定义,输入文件如下：
%mem=1500mb                           
%chk=L4-PCM2                           
#p  b3lyp/6-311++g** opt freq 5D SCRF=(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read) nosymm

L4-PCM2

0   1
6           0       -4.086788    1.164831   -0.001087
6           0       -4.000176   -0.249678   -0.006797
7           0       -2.831932   -0.889750   -0.007595
6           0       -1.713552   -0.162361   -0.002777
6           0       -1.661624    1.252053    0.003164
6           0       -2.920554    1.892355    0.003773
7           0       -5.125477   -1.024625   -0.011694
7           0       -0.512554   -0.858557   -0.003727
6           0        0.721810   -0.211941    0.000938
6           0        0.759503    1.206613    0.006901
6           0       -0.392222    1.942626    0.008090
6           0       -0.320638   -2.234223   -0.009061
6           0        1.028195   -2.464786   -0.007804
6           0        1.712850   -1.207903   -0.001522
6           0        3.154449   -0.967357    0.001861
8           0        3.631530    0.162924    0.007240
6           0        4.068017   -2.183960   -0.001425
6           0       -0.348792    3.448367    0.014450
1           0       -5.052909    1.655368   -0.000589
1           0       -2.969196    2.974461    0.008126
1           0       -5.026303   -2.025444   -0.015939
1           0       -6.044377   -0.620813   -0.012039
1           0        1.736499    1.669112    0.010425
1           0       -1.166074   -2.898116   -0.013174
1           0        1.484174   -3.442671   -0.011091
1           0        5.104004   -1.848064    0.001718
1           0        3.885948   -2.809168    0.877958
1           0        3.889014   -2.802117   -0.886404
1           0        0.683525    3.799507    0.017543
1           0       -0.847278    3.862946    0.897337
1           0       -0.844473    3.870368   -0.866500

stoichiometry=C4H6O3
solventname=Ethanoyl ethanoate
eps=21.00
epsinf=1.9329

运行后报错如下：QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
D,Solvent=Generic,PCM=Read) nosymm
                      '
Last state="SCR2"
TCursr=63935 LCursr=   61
Error termination via Lnk1e in F:\G09W\l1.exe at Sun Apr 27 14:52:47 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      1 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
不知道是什么原因，我实在看不出来，求高手帮帮忙，看看错在哪里？或者告诉我用乙酸酐作溶剂要怎么写？非常感谢！
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^_^不要生气||要争气，不要看破||要突破，不要嫉妒||要欣赏，不要托延||要积极，不要心动||要行动^_^
1楼 2014-04-27 20:17:27
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alexwpch

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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gougaozhan: 金币+5 2014-04-27 21:10:27
官网上现在例子的写法改成SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)，这样就可以了。
貌似是因为说明书是老旧的，G09的语法有所改变。
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2楼2014-04-27 21:01:48
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gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy
引用回帖:
2楼: Originally posted by alexwpch at 2014-04-27 21:01:48
官网上现在例子的写法改成SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)，这样就可以了。
貌似是因为说明书是老旧的，G09的语法有所改变。

我的及尺这样写的，但是一算就错，不知道什么原因
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^_^不要生气||要争气，不要看破||要突破，不要嫉妒||要欣赏，不要托延||要积极，不要心动||要行动^_^
3楼2014-04-27 21:10:19
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alexwpch

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gougaozhan at 2014-04-27 21:10:19
我的及尺这样写的，但是一算就错，不知道什么原因...

打错字，看不懂。
你的那个写法多了"PCM=",请看仔细了。可能G09的写法改变了，但是说明书还没来及修改，所以你用旧的写法会报错。
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4楼2014-04-28 07:47:30
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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gougaozhan: 金币+5 2014-04-28 10:29:12
引用回帖:
3楼: Originally posted by gougaozhan at 2014-04-27 21:10:19
我的及尺这样写的，但是一算就错，不知道什么原因...

2楼的方法是可以算的。仔细查看说明书，SMD和Read都是PCM的选项，他们的优先级应该一样，那为何SMD可以写在scrf下面，而read却要再写在pcm下面呢？可能是说明书的一个bug。至于你说的还是一算就错，不知道具体出错原因是否还是输入问题？
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5楼2014-04-28 08:08:54
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gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy
引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-28 08:08:54
2楼的方法是可以算的。仔细查看说明书，SMD和Read都是PCM的选项，他们的优先级应该一样，那为何SMD可以写在scrf下面，而read却要再写在pcm下面呢？可能是说明书的一个bug。至于你说的还是一算就错，不知道具体出错 ...

Gaussian官网的例子：
# B3LYP/6-31G(d) 5D SCRF(SMD,Solvent=Generic,Read)

Water, solvation by methanol, re-defined as generic solvent.

0 1
O
H,1,0.94
H,1,0.94,2,104.5

stoichiometry=C1H4O1  Input section for PCM keywords
solventname=methanol
eps=32.63
epsinf=1.758
…
                      Blank line terminates PCM input
我的就照这个写，不知道错在那了
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6楼2014-04-28 10:29:02
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gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy
引用回帖:
4楼: Originally posted by alexwpch at 2014-04-28 07:47:30
打错字，看不懂。
你的那个写法多了"PCM=",请看仔细了。可能G09的写法改变了，但是说明书还没来及修改，所以你用旧的写法会报错。...

不好意思，写着急了。我去了"PCM=",然后运行，但是也出错，错误提示如下：请帮忙看看，谢谢！
The following wrong keyword(s) have been found:
ETHANOATE
------------------------------------------------------------------------------
Error termination via Lnk1e in F:\G09W\l301.exe at Mon Apr 28 10:30:25 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  2.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
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7楼2014-04-28 10:32:57
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gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy
引用回帖:
4楼: Originally posted by alexwpch at 2014-04-28 07:47:30
打错字，看不懂。
你的那个写法多了"PCM=",请看仔细了。可能G09的写法改变了，但是说明书还没来及修改，所以你用旧的写法会报错。...

我搞定了，溶剂名我就用汉语拼音就不报错了，谢谢
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^_^不要生气||要争气，不要看破||要突破，不要嫉妒||要欣赏，不要托延||要积极，不要心动||要行动^_^
8楼2014-04-28 10:36:39
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dsdy

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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gougaozhan: 金币+5 2014-04-28 13:17:38
首先，关键词SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)，说明书上那个例子的确有问题；

其次，你的溶剂定义“solventname=Ethanoyl ethanoate”中出现空格，Gaussian会读取“solventname=Ethanoyl”部分，然后将“ethanoate”认为是多余关键词。你在solventname后面定义的时候没有空格就行了。
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9楼2014-04-28 11:00:26
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黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
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5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-27 12:08:54
2楼的方法是可以算的。仔细查看说明书，SMD和Read都是PCM的选项，他们的优先级应该一样，那为何SMD可以写在scrf下面，而read却要再写在pcm下面呢？可能是说明书的一个bug。至于你说的还是一算就错，不知道具体出错 ...

SMD和Read都是PCM的选项?
笑死了
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10楼2014-04-28 13:01:53
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