24小时热门版块排行榜    

查看: 2888  |  回复: 18

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 用vasp优化Ni2团簇出现的问题! 已有1人参与

各位前辈,大家好:
最近用vasp优化Ni2团簇,将Ni2放到边长为13的立方体盒子中,Ni,Ni 键长为2.42,KPOINTS,gamma下的kmesh不知道取多少,
Automatic generation
Gamma
-     -    -
0.0 0.0 0.0
于是就分别取2到13进行KPOINTS的收敛性测试,取到9还正常,但没有收敛,但从10开始,机器计算出现异常,如下:--------------------------------------------------------
  JOBID: 46876.cn061
  The job was started at Thu Mar 27 11:48:27 CST 2014
  The job was running at cn012.
k mesh = 10 x 10 x 10
running on    4 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Ni
POSCAR found :  1 types and       2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           1 )
WAVECAR not read
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 16304 on node cn012 exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------

real        1m4.034s
user        0m14.805s
sys        0m11.433s
k mesh = 11 x 11 x 11
running on    4 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Ni
POSCAR found :  1 types and       2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           1 )
WAVECAR not read
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 16324 on node cn012 exited on signal 9 (Killed).
。。。
这是怎么回事?望高手指导,感激不尽!
回复此楼

» 本帖@通知

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

好好研究,天天向上!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+5 2014-03-28 20:15:53
你的错误原因 是内存不足
KPOINTS应该为  
Automatic generation
Gamma
1 1 1
0.0 0.0 0.0

你取的K点密度太高了!
2楼2014-03-28 19:56:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

前辈,那意思就是说所有大小团簇优化,都是kpoint下的gamma都取111.不需要进行收敛性测试?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好研究,天天向上!
3楼2014-03-28 20:18:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-28 19:56:19
你的错误原因 是内存不足
KPOINTS应该为  
Automatic generation
Gamma
1 1 1
0.0 0.0 0.0

你取的K点密度太高了!

前辈,那意思就是说所有大小团簇优化,都是kpoint下的gamma都取111.不需要进行收敛性测试?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好研究,天天向上!
4楼2014-03-28 20:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小鑫000: 金币+5 2014-03-29 10:25:48
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-28 20:19:09
前辈,那意思就是说所有大小团簇优化,都是kpoint下的gamma都取111.不需要进行收敛性测试?
...

是的   因为你的box边长取的很大 仅需gamma点即可
5楼2014-03-28 21:18:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-28 21:18:37
是的   因为你的box边长取的很大 仅需gamma点即可...

谢谢前辈,我gamma下取111,进行encut的收敛性测试,结果机器运算出现异常,如下:
JOBID: 47025.cn061
  The job was started at Fri Mar 28 22:36:03 CST 2014
  The job was running at cn012.
ENCUT = 350 eV
running on    4 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Ni
POSCAR found :  1 types and       2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation


VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =       1


VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =       1


VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:


VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =       1
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =       1

real        0m1.609s
user        0m0.544s
sys        0m0.216s
这是怎么回事,但我取222,就能正常运算,但encut取从350取到500也没收敛,是怎么回事?
好好研究,天天向上!
6楼2014-03-29 10:43:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-29 10:43:42
谢谢前辈,我gamma下取111,进行encut的收敛性测试,结果机器运算出现异常,如下:
JOBID: 47025.cn061
  The job was started at Fri Mar 28 22:36:03 CST 2014
  The job was running at cn012.
ENCUT = 350  ...

ISMEAR取0 不要用-5
7楼2014-03-29 16:22:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-29 16:22:49
ISMEAR取0 不要用-5...

那前辈,为什么不能取-5.静态计算不是都取-5吗?取0的话,sigmar取多少呀?谢谢前辈了!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好研究,天天向上!
8楼2014-03-29 22:06:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小小鑫000: 金币+3 2014-03-30 16:56:28
引用回帖:
8楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-29 22:06:53
那前辈,为什么不能取-5.静态计算不是都取-5吗?取0的话,sigmar取多少呀?谢谢前辈了!
...

你的错误不是提示说 Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =       1
1个k点不能用Tetrahedron method
你应该仔细看看manual ismear那一项的介绍 上面写的很清楚
9楼2014-03-30 12:52:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-30 12:52:56
你的错误不是提示说 Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =       1
1个k点不能用Tetrahedron method
你应该仔细看看manual ismear那一项的介绍 上面写的很清楚...

前辈,盒子只能取成立方体的吗,取成长方体的行不行?
好好研究,天天向上!
10楼2014-04-01 11:44:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小小鑫000 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕306英一数二 +8 z1z2z3879 2026-03-16 10/500 2026-03-18 00:01 by 星空星月
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +7 yangfz 2026-03-17 7/350 2026-03-17 23:57 by 星空星月
[考研] 303求调剂 +3 睿08 2026-03-17 5/250 2026-03-17 22:01 by 睿08
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +4 share_joy 2026-03-16 4/200 2026-03-17 21:32 by hmn_wj
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +5 d如愿上岸 2026-03-12 8/400 2026-03-16 15:19 by peike
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +13 enenenhui 2026-03-13 14/700 2026-03-16 15:19 by 了了了了。。
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:05 by njzyff
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 336求调剂 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
信息提示
请填处理意见