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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 已知氨基酸序列，倒推DNA序列。
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木虫 (小有名气)

[求助] 已知氨基酸序列，倒推DNA序列。 已有2人参与

求助！！
已知氨基酸序列，倒推DNA序列。
由于简并性等原因，DNA序列有很多种可能性，
如何使倒推的DNA序列尽可能接近天然DNA序列？
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1楼 2014-03-28 15:54:16
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
XX.mp3: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-29 00:29:01
使倒推的DNA序列尽可能接近天然DNA序列，这真的很难做到，只能比对不同物种的这一基因的氨基酸序列，在保守区设计兼并引物
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2014-03-28 16:15:06
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XX.mp3

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2014-03-28 16:15:06
使倒推的DNA序列尽可能接近天然DNA序列，这真的很难做到，只能比对不同物种的这一基因的氨基酸序列，在保守区设计兼并引物

能不能通过密码子的偏好性，在一定程度上接近天然DNA呢？
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3楼2014-03-28 19:04:56
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283503264

银虫 (小有名气)
干嘛要倒推呢？ 搜索一下基因组中哪段序列编码这个多肽不就行啦
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Action is the food and drink which will nourish my success.
4楼2014-03-28 19:17:29
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283503264

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by XX.mp3 at 2014-03-28 19:04:56
能不能通过密码子的偏好性，在一定程度上接近天然DNA呢？...

不能
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Action is the food and drink which will nourish my success.
5楼2014-03-28 19:18:38
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XX.mp3

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 283503264 at 2014-03-28 20:17:29
干嘛要倒推呢？ 搜索一下基因组中哪段序列编码这个多肽不就行啦

搜数据库的方法我知道，这里是假设了一下数据库中没有的情况下。不好意思，之前我没说清楚。
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6楼2014-03-28 19:22:18
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XX.mp3

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 283503264 at 2014-03-28 20:18:38
不能...

能解释下为什么吗？
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7楼2014-03-28 19:24:18
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
XX.mp3: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-29 00:30:32
通过引入密码子使用偏性可以降低简并性
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8楼2014-03-29 00:26:11
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Mr.Nby

新虫 (小有名气)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-29 23:47:54
通过同源比对，找到保守氨基酸序列（7个或以上连续保守的），设计简并引物，再利用PCR技术找到目的基因。这样就行了。
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我不去想，未来是平坦还是泥泞，只要热爱生命，一切，都在意料之中。
9楼2014-03-29 11:52:17
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怎么都行

银虫 (小有名气)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-29 23:48:29
如果知道这个物种的密码子偏爱性，每个氨基酸都用它偏爱的密码子，这样倒推出来的序列可能最接近它基因的真实情况
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10楼2014-03-29 21:18:15
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