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lixin601木虫 (正式写手)
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序列中有多个终止密码子，基因序列提交不到到genbank，请看一下genbank的回信
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最近获得了一些微生物的KS基因序列，想提交到genbank，但提交了几次都不合格。不知道什么原因，还有别的办法吗？ We have noticed that some or all of the sequences contain internal stop codons and/or reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST similarity search results and/or an alignment). This generally indicates problems such as: - errors in the nucleotide sequence - sequences have not been trimmed of low quality - problems with feature annotation which may be due to: translation in the wrong reading frame or on the wrong strand translation does not have the correct exon spans translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's If the sequences and/or annotation are incorrect, please resubmit with the corrected files. If the information is correct, please explain the presence of the internal stop codons and/or frame shifts. If you are unable to determine the correct sequence and/or annotation for your sequence(s), they can still be processed and the following comment will be added to your records: COMMENT GenBank staff is unable to verify sequence and/or annotation provided by the submitter. In addition, the record(s) will indicate that the data are unverified and your sequence(s) will not be included in NCBI BLAST databases. |
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2楼2014-03-20 11:32:37
lixin601
木虫 (正式写手)
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3楼2014-03-20 12:43:52