| 查看: 2196 | 回复: 2 | ||
lixin601木虫 (正式写手)
|
[求助]
序列中有多个终止密码子，基因序列提交不到到genbank，请看一下genbank的回信
|
|
最近获得了一些微生物的KS基因序列，想提交到genbank，但提交了几次都不合格。不知道什么原因，还有别的办法吗？ We have noticed that some or all of the sequences contain internal stop codons and/or reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST similarity search results and/or an alignment). This generally indicates problems such as: - errors in the nucleotide sequence - sequences have not been trimmed of low quality - problems with feature annotation which may be due to: translation in the wrong reading frame or on the wrong strand translation does not have the correct exon spans translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's If the sequences and/or annotation are incorrect, please resubmit with the corrected files. If the information is correct, please explain the presence of the internal stop codons and/or frame shifts. If you are unable to determine the correct sequence and/or annotation for your sequence(s), they can still be processed and the following comment will be added to your records: COMMENT GenBank staff is unable to verify sequence and/or annotation provided by the submitter. In addition, the record(s) will indicate that the data are unverified and your sequence(s) will not be included in NCBI BLAST databases. |
回复此楼» 猜你喜欢
321求调剂
已经有5人回复
-
324求调剂
已经有6人回复
-
359求调剂
已经有7人回复
-
一志愿华北电力大学（北京），材料科学与工程学硕265，求调剂
已经有11人回复
-
368求调剂
已经有7人回复
-
288求调剂，一志愿华南理工大学071005
已经有3人回复
-
求生物学调剂
已经有13人回复
-
284求调剂
已经有3人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂
已经有8人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎么导出一段序列的互补序列
已经有7人回复
- 请问如何在genebank中检索玉米基因的启动子序列啊？
已经有3人回复
- 求助关于向Genbank提交序列的大小以及时间点等
已经有3人回复
- 怎么查找一段序列的上下游的序列呢？？？？？？急急急！！！
已经有6人回复
- 获得一段碱基序列，应该是个未知基因，如何确定起始密码子和终止密码子
已经有3人回复
- 如何寻找目的基因
已经有6人回复
- 求助——genbank基因组序列的查询
已经有4人回复
- 如何找到水稻一段序列的上下游序列？
已经有5人回复
- 用什么软件可以讲基因序列和氨基酸序列上下对应排列，就像文献中的那种
已经有8人回复
- genbank中的DNA序列方向与mrna方向？？
已经有3人回复
- 如何将Genbank序列导入BEAST或BEAUti软件
已经有7人回复
- 在做系统发育树的时候，如何从genbank上选择下载同源序列呢
已经有10人回复
- 用BankIt在线向Genbank数据库提交序列
已经有265人回复
- 请问在GenBank上找到了一条序列，怎样知道作者所用引物的序列？
已经有9人回复
- 向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎
已经有19人回复
- 向GENBANK提交的序列能随后修改吗？
已经有5人回复
- 我向Genbank提交了序列并收到了登录号，可我把那封邮件弄没了，怎么再获得登录号？
已经有12人回复
- 求教如何通过GenBankTM/EBI Data Bank 查到核酸序列
已经有5人回复
- 【求助/交流】求关于序列上传到GENBANK的相关问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】求助：如何能在genbank中快速批量下载序列
已经有6人回复
2楼2014-03-20 11:32:37
lixin601
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3066.6
- 散金: 109
- 红花: 7
- 帖子: 605
- 在线: 584.1小时
- 虫号: 470642
- 注册: 2007-11-29
- 专业: 微生物资源与分类学
3楼2014-03-20 12:43:52
