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五瓣丁香BBG金虫 (小有名气)
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求教如何通过GenBankTM/EBI Data Bank 查到核酸序列
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rt，我是外行，看到这个 The nucleotide sequence(s) reported in this paper has been submitted to the GenBankTM/EBI Data Bank with accession number(s) AB017626, AB017627, AB017628, and AB017629 (for ScGNA1, CaGNA1, SpGNA1, and CeGNA1, respectively) 我很想通过上述信息查到scgna1的基因序列！！ 先谢谢了 |
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 【分子生物】EPI帖 |
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【答案】应助回帖
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1949stone(金币+2): 了解 2011-05-24 15:43:06
1949stone(金币+2): 了解 2011-05-24 15:43:06
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（1） 这些信息中已经有了序列的申请号：AB017626, AB017627, AB017628, and AB017629 ，你可以直接在GenBank中输入，然后下载出来 （2）另外，文章中还给了名字： ScGNA1, CaGNA1, SpGNA1, and CeGNA1，你可以分别输入名字，在GenBank中找到相关序列。 要注意的是，你的序列是什么？是DNA、蛋白质、cDNA？还是其他，这个可以选择，当然也可以不选择，你具体操作一下就知道了。有问题在发信息给我。 祝福实验顺利！ |
2楼2011-05-24 14:25:50
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3楼2011-05-24 14:27:33
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4楼2011-05-24 14:53:21
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【答案】应助回帖
1949stone(EPI+1): 鉴于你的热情 与 解答 epi来也 2011-05-24 15:43:55
| 这个网站上有好多生物信息学的东西，可以学习http://abc.cbi.pku.edu.cn/ |
5楼2011-05-24 14:55:10
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AB017626 Saccharomyces cerevisiae ScGNA1 gene for acetyltransferase, complete cds GenBank: AB017626.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS AB017626 480 bp DNA linear PLN 08-JAN-1999 DEFINITION Saccharomyces cerevisiae ScGNA1 gene for acetyltransferase, complete cds. ACCESSION AB017626 VERSION AB017626.1 GI:4115732 KEYWORDS acetyltransferase; ScGNA1. SOURCE Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast) ORGANISM Saccharomyces cerevisiae Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Saccharomyces. REFERENCE 1 AUTHORS Mio,T., Yamada-Okabe,T., Arisawa,M. and Yamada-Okabe,H. TITLE Saccharomyces cerevisiae GNA1, an essential gene encoding a novel acetyltransferase involved in UDP-N-acetylglucosamine synthesis JOURNAL J. Biol. Chem. 274 (1), 424-429 (1999) PUBMED 9867860 REFERENCE 2 (bases 1 to 480) AUTHORS Okabe,H. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (12-SEP-1998) Hisafumi Okabe, Yokohama City University, School of Medicine, Department of Hygiene; 3-9 Fukuura, Kanazawa-ku, Yokohama, Kanagawa 236-0004, Japan (E-mail:toshiko@med.yokohama-cu.ac.jp, Tel:81-45-787-2606, Fax:81-45-786-5219) FEATURES Location/Qualifiers source 1..480 /organism="Saccharomyces cerevisiae" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:4932" gene 1..480 /gene="ScGNA1" CDS 1..480 /gene="ScGNA1" /codon_start=1 /product="acetyltransferase" /protein_id="BAA36495.1" /db_xref="GI:4115733" /translation="MSLPDGFYIRRMEEGDLEQVTETLKVLTTVGTITPESFSKLIKY WNEATVWNDNEDKKIMQYNPMVIVDKRTETVAATGNIIIERKIIHELGLCGHIEDIAV NSKYQGQGLGKLLIDQLVTIGFDYGCYKIILDCDEKNVKFYEKCGFSNAGVEMQIRK" ORIGIN 1 atgagcttac ccgatggatt ttatataagg cgaatggaag agggggattt ggaacaggtc 61 actgagacgc taaaggtttt gaccaccgtg ggcactatta cccccgaatc cttcagcaaa 121 ctcataaaat actggaatga agccacagta tggaatgata acgaagataa aaaaataatg 181 caatataacc ccatggtgat tgtggacaag cgcaccgaga cggttgccgc tacggggaat 241 atcatcatcg aaagaaagat cattcatgaa ctggggctat gtggccacat cgaggacatt 301 gcagtaaact ccaagtatca gggccaaggt ttgggcaagc tcttgattga tcaattggta 361 actatcggct ttgactacgg ttgttataag attattttag attgcgatga gaaaaatgtc 421 aaattctatg aaaaatgtgg gtttagcaac gcaggcgtgg aaatgcaaat tagaaaatag // |
6楼2011-05-24 20:17:48
