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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求教如何通过GenBankTM/EBI Data Bank 查到核酸序列
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五瓣丁香BBG

金虫 (小有名气)

[求助] 求教如何通过GenBankTM/EBI Data Bank 查到核酸序列

rt，我是外行，看到这个
The nucleotide sequence(s) reported in this paper has been submitted to the GenBankTM/EBI Data Bank with accession number(s) AB017626, AB017627, AB017628, and AB017629 (for ScGNA1, CaGNA1, SpGNA1, and CeGNA1, respectively)

我很想通过上述信息查到scgna1的基因序列！！
先谢谢了
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1楼2011-05-24 14:12:16
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
1949stone(金币+2): 了解 2011-05-24 15:43:06
（1） 这些信息中已经有了序列的申请号：AB017626, AB017627, AB017628, and AB017629 ，你可以直接在GenBank中输入，然后下载出来
（2）另外，文章中还给了名字： ScGNA1, CaGNA1, SpGNA1, and CeGNA1，你可以分别输入名字，在GenBank中找到相关序列。
     要注意的是，你的序列是什么？是DNA、蛋白质、cDNA？还是其他，这个可以选择，当然也可以不选择，你具体操作一下就知道了。有问题在发信息给我。
    祝福实验顺利！
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2楼2011-05-24 14:25:50
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
五瓣丁香BBG(金币+10): 呵呵，谢谢 2011-05-24 14:55:23
1949stone(金币+2): 欢迎补充 2011-05-24 15:43:15
没仔细看你的帖子，不好意思，AB017626就是scgna1的基因序列登陆号，你可以直接输入，然后下载。
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3楼2011-05-24 14:27:33
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
1949stone(金币+1): 不错 2011-05-24 15:43:31
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/这是GenBank的网址
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4楼2011-05-24 14:53:21
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1949stone(EPI+1): 鉴于你的热情 与 解答 epi来也 2011-05-24 15:43:55
这个网站上有好多生物信息学的东西，可以学习http://abc.cbi.pku.edu.cn/
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5楼2011-05-24 14:55:10
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AB017626


Saccharomyces cerevisiae ScGNA1 gene for acetyltransferase, complete cds
GenBank: AB017626.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       AB017626                 480 bp    DNA     linear   PLN 08-JAN-1999
DEFINITION  Saccharomyces cerevisiae ScGNA1 gene for acetyltransferase,
            complete cds.
ACCESSION   AB017626
VERSION     AB017626.1  GI:4115732
KEYWORDS    acetyltransferase; ScGNA1.
SOURCE      Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast)
  ORGANISM  Saccharomyces cerevisiae
            Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina;
            Saccharomycetes; Saccharomycetales; Saccharomycetaceae;
            Saccharomyces.
REFERENCE   1
  AUTHORS   Mio,T., Yamada-Okabe,T., Arisawa,M. and Yamada-Okabe,H.
  TITLE     Saccharomyces cerevisiae GNA1, an essential gene encoding a novel
            acetyltransferase involved in UDP-N-acetylglucosamine synthesis
  JOURNAL   J. Biol. Chem. 274 (1), 424-429 (1999)
   PUBMED   9867860
REFERENCE   2  (bases 1 to 480)
  AUTHORS   Okabe,H.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (12-SEP-1998) Hisafumi Okabe, Yokohama City University,
            School of Medicine, Department of Hygiene; 3-9 Fukuura,
            Kanazawa-ku, Yokohama, Kanagawa 236-0004, Japan
            (E-mail:toshiko@med.yokohama-cu.ac.jp, Tel:81-45-787-2606,
            Fax:81-45-786-5219)
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..480
                     /organism="Saccharomyces cerevisiae"
                     /mol_type="genomic DNA"
                     /db_xref="taxon:4932"
     gene            1..480
                     /gene="ScGNA1"
     CDS             1..480
                     /gene="ScGNA1"
                     /codon_start=1
                     /product="acetyltransferase"
                     /protein_id="BAA36495.1"
                     /db_xref="GI:4115733"
                     /translation="MSLPDGFYIRRMEEGDLEQVTETLKVLTTVGTITPESFSKLIKY
                     WNEATVWNDNEDKKIMQYNPMVIVDKRTETVAATGNIIIERKIIHELGLCGHIEDIAV
                     NSKYQGQGLGKLLIDQLVTIGFDYGCYKIILDCDEKNVKFYEKCGFSNAGVEMQIRK"
ORIGIN      
        1 atgagcttac ccgatggatt ttatataagg cgaatggaag agggggattt ggaacaggtc
       61 actgagacgc taaaggtttt gaccaccgtg ggcactatta cccccgaatc cttcagcaaa
      121 ctcataaaat actggaatga agccacagta tggaatgata acgaagataa aaaaataatg
      181 caatataacc ccatggtgat tgtggacaag cgcaccgaga cggttgccgc tacggggaat
      241 atcatcatcg aaagaaagat cattcatgaa ctggggctat gtggccacat cgaggacatt
      301 gcagtaaact ccaagtatca gggccaaggt ttgggcaagc tcttgattga tcaattggta
      361 actatcggct ttgactacgg ttgttataag attattttag attgcgatga gaaaaatgtc
      421 aaattctatg aaaaatgtgg gtttagcaac gcaggcgtgg aaatgcaaat tagaaaatag
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6楼2011-05-24 20:17:48
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