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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 干扰/敲除 » miRNA与靶基因
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蓝色苹果

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] miRNA与靶基因 已有2人参与

我构建了一个植物（取全部组织）的miRNA文库，找公司给我分析的数据。有一个miRNA是我想继续做下去的，但公司给我预测的靶基因是个文库里的序列，我用RNAhybrid比较发现配对结果一般：
miRNA与靶基因

我无意间发现我想做的这个miRNA与我以前做过的一个基因的匹配结果非常好：
miRNA与靶基因-1

我的问题是：
1、我还有必要做公司给我预测的那个靶基因吗？如果要进行下一步验证，起码要满足什么标准？
2、miRNA与基因如果完全匹配，是否就意味着这个基因100%就是miRNA的靶基因呢？还是必须要经过进一步的试验验证？
3、在植物上除了RLM-5’RACE法验证靶基因，还有什么方法可以，请简单介绍下。

请有实践经验的虫友多多指教，勿用百度的结果来参和！！！谢谢！！！
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知识是需要不断的积累和交流的。
1楼 2014-03-08 21:46:37
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yyshpy007

禁虫 (正式写手)
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-09 09:37:05
蓝色苹果: 金币+3, ★有帮助 2014-03-10 22:53:36
本帖内容被屏蔽
2楼2014-03-09 01:16:22
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yuehedou

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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蓝色苹果: 金币+4, ★有帮助 2014-03-10 22:53:58
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 16:32:28
我觉得可以优先做你自己那个匹配度更高的基因~一个micro可能有多个靶基因，公司预测的那个也不见得是错的，不过匹配度更高应该更可靠。
另外验证时更经典的是可以用构建突变株的方式验证吧，这样可以从功能上验证，不过难度大了些。。。
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每天都为自己的无知而羞耻！
3楼2014-03-09 11:36:27
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