24小时热门版块排行榜    

查看: 3698  |  回复: 9

没入尘埃5

金虫 (小有名气)

[求助] miRNA的靶基因怎么预测啊?

怎么知道miRNA与什么激素相关?怎么预测miRNA的靶基因啊?急求帮助!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

研究生忙忙碌碌 精彩

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

如果不努力,肯定没收获!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
古可ぷ: 金币+1, 谢谢交流 2013-03-04 19:13:12
没入尘埃5: 金币+10 2013-03-11 16:54:49
targetscan啊。。。先软件预测。再用荧光素酶报告法验证或者pcr验证。。
keepon
2楼2013-03-04 17:45:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

9号逐梦客

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
古可ぷ: 金币+2, 谢谢交流 2013-03-04 19:13:26
microRNA的靶基因的预测已经有很多数据库了,比较常用的是targetscan,其余的还有starbase,RNA22,miRtarbase等,你都可以在这些软件上预测一下。它会有一些匹配分值给你,一般是从高到低,可以参考下。
为了梦想不断坚持在路上
3楼2013-03-04 17:57:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

没入尘埃5

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2013-03-04 17:45:50
targetscan啊。。。先软件预测。再用荧光素酶报告法验证或者pcr验证。。

我看这个软件都是动物的啊,没有植物的
如果不努力,肯定没收获!
4楼2013-03-04 18:47:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

没入尘埃5

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 9号逐梦客 at 2013-03-04 17:57:42
microRNA的靶基因的预测已经有很多数据库了,比较常用的是targetscan,其余的还有starbase,RNA22,miRtarbase等,你都可以在这些软件上预测一下。它会有一些匹配分值给你,一般是从高到低,可以参考下。

不太懂匹配分值是什么,没预测过,这几个软件哪个是可以预测植物miRNA的啊?
如果不努力,肯定没收获!
5楼2013-03-04 18:51:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

9号逐梦客

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
没入尘埃5: 金币+10 2013-03-11 16:54:35
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-04-29 14:38:54
引用回帖:
5楼: Originally posted by 没入尘埃5 at 2013-03-04 18:51:26
不太懂匹配分值是什么,没预测过,这几个软件哪个是可以预测植物miRNA的啊?...

预测植物的microRNA啊,这个我不知道啊,因为不做植物,所以没有怎么关注,不过你可以在那些网站上查查看,或者先找几篇植物相关的microRNA文章,看看,一般都会有报道的。
为了梦想不断坚持在路上
6楼2013-03-06 08:36:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我觉得楼主可以先查点文献看下。。。至于靶点预测的话。。很多预测软件里面有种属选择的。。你可以从那里面看下,。。
keepon
7楼2013-04-16 08:44:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我要学perl么

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2013-03-04 17:45:50
targetscan啊。。。先软件预测。再用荧光素酶报告法验证或者pcr验证。。

我想问一下。
可否预测猪的microRNA靶标?
或者根据序列而不是基因名称来预测其microRNA结合位点?
8楼2013-07-10 18:19:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

央宗兰泽

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 9号逐梦客 at 2013-03-04 17:57:42
microRNA的靶基因的预测已经有很多数据库了,比较常用的是targetscan,其余的还有starbase,RNA22,miRtarbase等,你都可以在这些软件上预测一下。它会有一些匹配分值给你,一般是从高到低,可以参考下。

麻烦问一下,我看上面都是已知miRNA名字的可以预测,那么未知miRNA怎么预测?
9楼2017-03-29 10:03:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

临床碎月

新虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 央宗兰泽 at 2017-03-29 10:03:13
麻烦问一下,我看上面都是已知miRNA名字的可以预测,那么未知miRNA怎么预测?...

推类,比如说在这个疾病中有发现,那在另外一个疾病中还没有验证过,
10楼2019-03-27 15:27:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 没入尘埃5 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 10:26 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:52 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:24 by JzYBbHIXWSrW
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 09:18 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:34 by ZvyPK8n6Nfki
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:18 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[有机交流] 同一个分子,一条来自文献,一条来自AI——不告诉你答案,你会选哪条? +3 tianxiaoxian 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:44 by tianxiaoxian
[找工作] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:28 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-28 22:21 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
请填处理意见