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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » miRNA的靶基因怎么预测啊？
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)

[求助] miRNA的靶基因怎么预测啊？

怎么知道miRNA与什么激素相关？怎么预测miRNA的靶基因啊？急求帮助！
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如果不努力，肯定没收获！
1楼 2013-03-04 14:32:58
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zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
古可ぷ: 金币+1, 谢谢交流 2013-03-04 19:13:12
没入尘埃5: 金币+10 2013-03-11 16:54:49
targetscan啊。。。先软件预测。再用荧光素酶报告法验证或者pcr验证。。
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keepon
2楼2013-03-04 17:45:50
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9号逐梦客

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
古可ぷ: 金币+2, 谢谢交流 2013-03-04 19:13:26
microRNA的靶基因的预测已经有很多数据库了，比较常用的是targetscan，其余的还有starbase，RNA22,miRtarbase等，你都可以在这些软件上预测一下。它会有一些匹配分值给你，一般是从高到低，可以参考下。
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为了梦想不断坚持在路上
3楼2013-03-04 17:57:42
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2013-03-04 17:45:50
targetscan啊。。。先软件预测。再用荧光素酶报告法验证或者pcr验证。。

我看这个软件都是动物的啊，没有植物的
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如果不努力，肯定没收获！
4楼2013-03-04 18:47:26
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 9号逐梦客 at 2013-03-04 17:57:42
microRNA的靶基因的预测已经有很多数据库了，比较常用的是targetscan，其余的还有starbase，RNA22,miRtarbase等，你都可以在这些软件上预测一下。它会有一些匹配分值给你，一般是从高到低，可以参考下。

不太懂匹配分值是什么，没预测过，这几个软件哪个是可以预测植物miRNA的啊？
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如果不努力，肯定没收获！
5楼2013-03-04 18:51:26
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9号逐梦客

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
没入尘埃5: 金币+10 2013-03-11 16:54:35
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-04-29 14:38:54
引用回帖:
5楼: Originally posted by 没入尘埃5 at 2013-03-04 18:51:26
不太懂匹配分值是什么，没预测过，这几个软件哪个是可以预测植物miRNA的啊？...

预测植物的microRNA啊，这个我不知道啊，因为不做植物，所以没有怎么关注，不过你可以在那些网站上查查看，或者先找几篇植物相关的microRNA文章，看看，一般都会有报道的。
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为了梦想不断坚持在路上
6楼2013-03-06 08:36:42
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zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我觉得楼主可以先查点文献看下。。。至于靶点预测的话。。很多预测软件里面有种属选择的。。你可以从那里面看下，。。
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keepon
7楼2013-04-16 08:44:02
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我要学perl么

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2013-03-04 17:45:50
targetscan啊。。。先软件预测。再用荧光素酶报告法验证或者pcr验证。。

我想问一下。
可否预测猪的microRNA靶标？
或者根据序列而不是基因名称来预测其microRNA结合位点？
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8楼2013-07-10 18:19:01
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央宗兰泽

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 9号逐梦客 at 2013-03-04 17:57:42
microRNA的靶基因的预测已经有很多数据库了，比较常用的是targetscan，其余的还有starbase，RNA22,miRtarbase等，你都可以在这些软件上预测一下。它会有一些匹配分值给你，一般是从高到低，可以参考下。

麻烦问一下，我看上面都是已知miRNA名字的可以预测，那么未知miRNA怎么预测？
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9楼2017-03-29 10:03:13
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临床碎月

新虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 央宗兰泽 at 2017-03-29 10:03:13
麻烦问一下，我看上面都是已知miRNA名字的可以预测，那么未知miRNA怎么预测？...

推类，比如说在这个疾病中有发现，那在另外一个疾病中还没有验证过，
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10楼2019-03-27 15:27:18
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