应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 怎样选择已知基因的miRNA?
61/1返回列表
查看: 1181  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

小可123

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样选择已知基因的miRNA?

各位前辈，我想设计一条mirna同时让两个基因都沉默，是不是要针对两个基因的同源区域进行设计？要找两条序列的同源区域，是不是用nucleotide blast，然后选择Align two or more sequences输入两天序列比对即可？还有，我用wmd3设计了已知基因的miRNA,可是软件给了很多结果，如何从众多结果中挑选较好的mirna序列呢？因为是新手，所以又好的问题，希望各位能帮忙，在此先谢谢啦~~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-11-15 23:23:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小可123: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-11-18 20:50:14
小丹木木: 金币+4, 鼓励应助 2012-11-19 13:56:46
amiRNA设计是该技术的第一步，也是成功与否的关键步骤（Warthmann等，2008）。一个优化的amiRNA在序列上通常要满足以下条件：（1）第1位碱基通常是U；（2）第10位碱基通常是A，这是由RISC复合体中核酸内切酶内在作用特点决定的（Schwab等，2006）；（3）5′端保持不稳定性，即5′端AU含量最好要高一些。研究发现小RNA 5′端的不稳定性是小RNA高效作用的主要原因，同时只有这样的小干扰RNA才能有效地整合入RISC；（4）第2位与第12位碱基之间最多只能有1个错配碱基，该错配碱基不能位于切割位点上，即不要出现在第10和第11位碱基上（Lin等，2009）；（5）在第13位和第21位碱基之间最多只能出现4个错配碱基，并且不要连续出现2个或2个以上的错配碱基（Ameres等，2007；Schwab等，2005）；（6）尽可能在全基因组范围内考虑amiRNA和mRNA的关系，减少amiRNA作用的非特异性；（7）针对外源病毒基因的amiRNA与病毒基因序列可以完全互补配对，能有效提高沉默效应。这些设计原则被总结并公布在网站（http://wmd.weigelworld.org/cgi-bin/mirnatools.pl）上
赞一下(1人) 回复此楼
jiayoubashaonian
2楼2012-11-16 07:49:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
如果方便的话，我这里有些资料，可以发给您，祝顺利！
赞一下 回复此楼
jiayoubashaonian
3楼2012-11-16 07:50:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小可123

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by blackrose8089 at 2012-11-16 07:50:32
如果方便的话，我这里有些资料，可以发给您，祝顺利！

呜呜呜，太感谢你了，我的邮箱nanamalina@163.com
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-18 20:49:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小可123 at 2012-11-18 20:49:58
呜呜呜，太感谢你了，我的邮箱nanamalina@163.com...

好的，我给你发一下
赞一下 回复此楼
jiayoubashaonian
5楼2012-11-19 10:54:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsintsiao

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2012-11-16 07:49:39
amiRNA设计是该技术的第一步，也是成功与否的关键步骤（Warthmann等，2008）。一个优化的amiRNA在序列上通常要满足以下条件：（1）第1位碱基通常是U；（2）第10位碱基通常是A，这是由RISC复合体中核酸内切酶内在作用 ...

麻烦给我也发一份吧，tsinemail@163.com,谢谢
赞一下 回复此楼
try...untilthelastsecond
6楼2017-07-20 20:27:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小可123 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 332求调剂 +5 Zz版 2026-03-13 5/250 2026-03-17 11:01 by JineShine
[考研] 271求调剂 +12 生如夏花… 2026-03-11 14/700 2026-03-17 10:56 by lovewei0727
[考研] 290求调剂 +6 @将就将就看 2026-03-10 11/550 2026-03-17 10:22 by @将就将就看
[考研] [复试调剂]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 309求调剂 +5 花与叶@ 2026-03-10 5/250 2026-03-16 14:13 by 哦哦123
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 收调剂 +7 调剂的考研学生 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:57 by 麦茶汤圆
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭