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miRNA靶基因预测软件都有哪些?哪些好用?
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miRNA靶基因预测软件都有哪些?哪些好用?
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如题,各位大侠,给位专家,能不能介绍几个miRNA靶基因预测的软件,比较好用的
另外,这些软件怎么得到?
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2013-09-07 11:09:00
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2013-09-07 21:29:25
这个,简单易用,效果不错。真有靶基因的话基本能预测出来。
http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/
这个,中大教授做到降解组数据库,可以查询miRNA靶基因,由于有降解组数据支持,可靠性很高。
http://starbase.sysu.edu.cn/degradomeSeq.php
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2013-09-07 16:13:41
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2楼
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XOooZzz
at 2013-09-07 16:13:41
这个,简单易用,效果不错。真有靶基因的话基本能预测出来。
http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/
这个,中大教授做到降解组数据库,可以查询miRNA靶基因,由于有降解组数据支持,可靠性很高。
http://starb ...
你好,感谢热心帮助,你给我的两个链接,上面那个是植物的,下面那个是动物的,可是只有人和老鼠,我要用牛的
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2013-09-07 17:14:19
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2013-09-10 10:43:21
kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2013-09-20 20:15:46
刚才偶然看到这个:
http://www.targetscan.org/
没用过,你试试。
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2013-09-08 23:41:30
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2013-09-20 20:15:50
miRBase, TargetScan ,PicTar ,PITA, 排前面的应该更好用吧 用的多
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2013-09-14 21:31:56
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miRBase, TargetScan ,PicTar 链接分别是http://www.targetscan.org/vert_61/,http://pictar.mdc-berlin.de/ ttp://www.microrna.org/microrna/getDownloads.do
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2015-01-28 15:36:56
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不好意思,第三个链接是miRanda的
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7楼
2015-01-28 15:39:16
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710879778
at 2015-01-28 15:39:16
不好意思,第三个链接是miRanda的
请问您有相关的本地预测软件没有,我刚进行高通量测序,也有想做的候选基因,但是没有相关的本地预测软件安装包,请问您能不能发我一下(邮箱:
liuhongzhu2017@outlook.com
),感激不尽!
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卧薪藏胆,三千越甲可吞吴
8楼
2018-08-29 22:52:51
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at 2013-09-14 21:31:56
miRBase, TargetScan ,PicTar ,PITA, 排前面的应该更好用吧 用的多
请问您有相关的本地预测软件没有,我刚进行高通量测序,也有想做的候选基因,但是没有相关的本地预测软件安装包,请问您能不能发我一下(邮箱:
liuhongzhu2017@outlook.com
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卧薪藏胆,三千越甲可吞吴
9楼
2018-08-29 22:53:05
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你好,感谢热心帮助,你给我的两个链接,上面那个是植物的,下面那个是动物的,可是只有人和老鼠,我要用牛的...
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2018-08-29 22:53:26
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