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你是我的幸福

新虫 (正式写手)

[求助] miRNA靶基因预测软件都有哪些?哪些好用? 已有1人参与

如题,各位大侠,给位专家,能不能介绍几个miRNA靶基因预测的软件,比较好用的
另外,这些软件怎么得到?
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XOooZzz

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-09-07 21:29:25
这个,简单易用,效果不错。真有靶基因的话基本能预测出来。
http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/
这个,中大教授做到降解组数据库,可以查询miRNA靶基因,由于有降解组数据支持,可靠性很高。
http://starbase.sysu.edu.cn/degradomeSeq.php
2楼2013-09-07 16:13:41
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你是我的幸福

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by XOooZzz at 2013-09-07 16:13:41
这个,简单易用,效果不错。真有靶基因的话基本能预测出来。
http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/
这个,中大教授做到降解组数据库,可以查询miRNA靶基因,由于有降解组数据支持,可靠性很高。
http://starb ...

你好,感谢热心帮助,你给我的两个链接,上面那个是植物的,下面那个是动物的,可是只有人和老鼠,我要用牛的
3楼2013-09-07 17:14:19
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XOooZzz

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
你是我的幸福: 金币+2, 有帮助 2013-09-10 10:43:21
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-20 20:15:46
刚才偶然看到这个:
http://www.targetscan.org/
没用过,你试试。
4楼2013-09-08 23:41:30
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emma_juan

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-20 20:15:50
miRBase, TargetScan  ,PicTar  ,PITA, 排前面的应该更好用吧  用的多
5楼2013-09-14 21:31:56
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710879778

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

miRBase, TargetScan  ,PicTar     链接分别是http://www.targetscan.org/vert_61/,http://pictar.mdc-berlin.de/       ttp://www.microrna.org/microrna/getDownloads.do
6楼2015-01-28 15:36:56
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710879778

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

不好意思,第三个链接是miRanda的
7楼2015-01-28 15:39:16
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残留躯壳

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 710879778 at 2015-01-28 15:39:16
不好意思,第三个链接是miRanda的

请问您有相关的本地预测软件没有,我刚进行高通量测序,也有想做的候选基因,但是没有相关的本地预测软件安装包,请问您能不能发我一下(邮箱:liuhongzhu2017@outlook.com),感激不尽!
卧薪藏胆,三千越甲可吞吴
8楼2018-08-29 22:52:51
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残留躯壳

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by emma_juan at 2013-09-14 21:31:56
miRBase, TargetScan  ,PicTar  ,PITA, 排前面的应该更好用吧  用的多

请问您有相关的本地预测软件没有,我刚进行高通量测序,也有想做的候选基因,但是没有相关的本地预测软件安装包,请问您能不能发我一下(邮箱:liuhongzhu2017@outlook.com),感激不尽!
卧薪藏胆,三千越甲可吞吴
9楼2018-08-29 22:53:05
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残留躯壳

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 你是我的幸福 at 2013-09-07 17:14:19
你好,感谢热心帮助,你给我的两个链接,上面那个是植物的,下面那个是动物的,可是只有人和老鼠,我要用牛的...

请问您有相关的本地预测软件没有,我刚进行高通量测序,也有想做的候选基因,但是没有相关的本地预测软件安装包,请问您能不能发我一下(邮箱:liuhongzhu2017@outlook.com),感激不尽!
卧薪藏胆,三千越甲可吞吴
10楼2018-08-29 22:53:26
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