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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » miRNA靶基因预测软件都有哪些？哪些好用？
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你是我的幸福

新虫 (正式写手)

[求助] miRNA靶基因预测软件都有哪些？哪些好用？ 已有1人参与

如题，各位大侠，给位专家，能不能介绍几个miRNA靶基因预测的软件，比较好用的
另外，这些软件怎么得到？
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1楼 2013-09-07 11:09:00
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

XOooZzz

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-09-07 21:29:25
这个，简单易用，效果不错。真有靶基因的话基本能预测出来。
http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/
这个，中大教授做到降解组数据库，可以查询miRNA靶基因，由于有降解组数据支持，可靠性很高。
http://starbase.sysu.edu.cn/degradomeSeq.php
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2楼2013-09-07 16:13:41
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普通回帖

你是我的幸福

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by XOooZzz at 2013-09-07 16:13:41
这个，简单易用，效果不错。真有靶基因的话基本能预测出来。
http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/
这个，中大教授做到降解组数据库，可以查询miRNA靶基因，由于有降解组数据支持，可靠性很高。
http://starb ...

你好，感谢热心帮助，你给我的两个链接，上面那个是植物的，下面那个是动物的，可是只有人和老鼠，我要用牛的
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3楼2013-09-07 17:14:19
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XOooZzz

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
你是我的幸福: 金币+2, ★有帮助 2013-09-10 10:43:21
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-20 20:15:46
刚才偶然看到这个：
http://www.targetscan.org/
没用过，你试试。
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4楼2013-09-08 23:41:30
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emma_juan

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-20 20:15:50
miRBase， TargetScan  ，PicTar  ，PITA， 排前面的应该更好用吧  用的多
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5楼2013-09-14 21:31:56
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710879778

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

miRBase， TargetScan  ，PicTar     链接分别是http://www.targetscan.org/vert_61/，http://pictar.mdc-berlin.de/       ttp://www.microrna.org/microrna/getDownloads.do
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6楼2015-01-28 15:36:56
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710879778

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

不好意思，第三个链接是miRanda的
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7楼2015-01-28 15:39:16
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残留躯壳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 710879778 at 2015-01-28 15:39:16
不好意思，第三个链接是miRanda的

请问您有相关的本地预测软件没有，我刚进行高通量测序，也有想做的候选基因，但是没有相关的本地预测软件安装包，请问您能不能发我一下（邮箱：liuhongzhu2017@outlook.com）,感激不尽！
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卧薪藏胆，三千越甲可吞吴
8楼2018-08-29 22:52:51
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残留躯壳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by emma_juan at 2013-09-14 21:31:56
miRBase， TargetScan  ，PicTar  ，PITA， 排前面的应该更好用吧  用的多

请问您有相关的本地预测软件没有，我刚进行高通量测序，也有想做的候选基因，但是没有相关的本地预测软件安装包，请问您能不能发我一下（邮箱：liuhongzhu2017@outlook.com）,感激不尽！
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卧薪藏胆，三千越甲可吞吴
9楼2018-08-29 22:53:05
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残留躯壳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 你是我的幸福 at 2013-09-07 17:14:19
你好，感谢热心帮助，你给我的两个链接，上面那个是植物的，下面那个是动物的，可是只有人和老鼠，我要用牛的...

请问您有相关的本地预测软件没有，我刚进行高通量测序，也有想做的候选基因，但是没有相关的本地预测软件安装包，请问您能不能发我一下（邮箱：liuhongzhu2017@outlook.com）,感激不尽！
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卧薪藏胆，三千越甲可吞吴
10楼2018-08-29 22:53:26
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