24小时热门版块排行榜    

查看: 1297  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] 诡异的dmol3?! 已有9人参与

背景:不论是我的pc还是我的服务器 都关闭了超线程了
pc的cpu是i3的,双核;服务器的cpu是当年E5的32nm的早期型号,两颗,每颗6核,共12核
pc是win7,服务器是centos6

是这样 一个dmol3任务 400+个原子 全都是C/H/N 无对称 无周期 方法b3lyp,加grimme的disp校正,基组dnd3.5

我放在pc上跑 只见两颗i3的核心全部飙到100% 我满意地走了 一夜又一上午过去了 结果一共跑了10个step

我怒了 这也太慢了 强制结束 扔进服务器里 只见12颗e5的核心全部飙到100% 我满意地关了xshell 跑了一下午又一晚上,早上一开 一共跑了12个step

我瞠目结舌了 这服务器还有没有节操?

[ Last edited by yjcmwgk on 2014-3-5 at 09:34 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
假设CPU速度一样,12核和双核 也应该是能拉开差距的啊

内存不够会报错,我推测可能硬盘读写速度成了瓶颈

难道是装不下,虚拟内存,或者SWAP 区 反复在磁盘里倒腾这样的感觉

另外PC跑400个原子得多大内存啊。。。
3楼2014-03-05 16:33:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

lgxyz

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你用的7.0?b3lyp可能就是慢,用纯泛函试试PBE,应该不会这么慢。
2楼2014-03-05 11:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by qzhost at 2014-03-05 16:33:25
假设CPU速度一样,12核和双核 也应该是能拉开差距的啊

内存不够会报错,我推测可能硬盘读写速度成了瓶颈

难道是装不下,虚拟内存,或者SWAP 区 反复在磁盘里倒腾这样的感觉

另外PC跑400个原子得多大内存啊 ...

其实没用多大内存啦
我的pc有4G内存 win7只给我认出来3G多 有几百兆被win7吃了
然后 平时不跑任务 系统占用七八百兆
跑这个任务的时候 内存也才占到了2.4G-2.6G的样子
其实吧 现在的PC 不配4G不幸福
4楼2014-03-05 17:08:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Xterm下用top命令后按数字1看看,cpu很可能不是100%。我这两天在帮学校某个组搭集群,也发觉dmol效率很差。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
5楼2014-03-05 17:24:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +3 匹克i 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:18 by peike
[考研] 材料292调剂 +4 橘颂思美人 2026-03-23 4/200 2026-03-23 23:16 by peike
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 265求调剂 +10 梁梁校校 2026-03-17 10/500 2026-03-23 21:17 by 一切OK
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 +4 石能伟 2026-03-17 4/200 2026-03-23 17:51 by 17862566385
[考研] 材料与化工考研调剂 +4 孅華 2026-03-22 4/200 2026-03-23 16:13 by 一休哥FU
[考研] 352求调剂 +3 大米饭! 2026-03-22 3/150 2026-03-22 23:28 by king123!
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 280求调剂 +11 咕噜晓晓 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:40 by ACS Nano——
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
信息提示
请填处理意见