应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】用Dmol3 TS search失败的原因，请大伙指点
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 2536  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xiaojivan

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用Dmol3 TS search失败的原因，请大伙指点 已有4人参与

Unable to bracket maximum fron both endpoints
Please check endpoints
cumulative number of energy/gradient call: 17



这是什么意思，求详解
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-03-20 15:28:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liancsh

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-21 11:04:16
引用回帖:
Originally posted by xiaojivan at 2011-03-20 15:28:10:
Unable to bracket maximum fron both endpoints
Please check endpoints
cumulative number of energy/gradient call: 17



这是什么意思，求详解

估计是你在ts search 前的路径文件的建立过程中出现小问题。
赞一下(2人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

毛毛虫_
2楼2011-03-21 09:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaojivan

新虫 (小有名气)
是不是把反应物和产物的xsd文件找到，原子配对然后弄出一个xcd文件，然后search这个xcd文件啊？
赞一下 回复此楼
3楼2011-03-21 11:48:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liancsh

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-03-21 15:12:35
引用回帖:
Originally posted by xiaojivan at 2011-03-21 11:48:22:
是不是把反应物和产物的xsd文件找到，原子配对然后弄出一个xcd文件，然后search这个xcd文件啊？

不是xcd图表文件，"c"---Chart，而是xtd路径文件，"t"--- Trajectory
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-03-21 14:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

charityqi

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-03-21 21:37:39
也就是说根据你给的两个端点（反应物和生成物）的构型不能搜索得到过渡态，可能是你反应物和生成物建立的构型不合理造成的，应该更改反应物或者产物的构型
赞一下(3人) 回复此楼
5楼2011-03-21 21:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

毛毛虫_

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaojivan at 2011-03-21 11:48:22
是不是把反应物和产物的xsd文件找到，原子配对然后弄出一个xcd文件，然后search这个xcd文件啊？

您好，问题解决了吗？dmol怎么找TS呢？把反应物和产物优化完的xtd文件放到一个文件夹吗？还是怎么弄？计算那个文件的TS呢？
赞一下 回复此楼
努力爬行的小虫子·····
6楼2016-04-24 14:34:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

毛毛虫_

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liancsh at 2011-03-21 09:52:19
估计是你在ts search 前的路径文件的建立过程中出现小问题。...

dmol怎么搜索Ts呢？优化完反应物和产物的结构之后，应该对哪个文件进行TS搜索呢？是自己重新构建一个文件搜索？还是把反应物和产物优化完的结构放到一个文件夹里面，到底是计算哪个文件？
赞一下 回复此楼
努力爬行的小虫子·····
7楼2016-04-24 14:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liancsh

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 毛毛虫_ at 2016-04-24 14:37:05
dmol怎么搜索Ts呢？优化完反应物和产物的结构之后，应该对哪个文件进行TS搜索呢？是自己重新构建一个文件搜索？还是把反应物和产物优化完的结构放到一个文件夹里面，到底是计算哪个文件？...

可以参见MS自带的关于dmol3软件的tutorial中Transition-state searching using LST/QST tools这一部分进行，TS搜索应该是对一个路径文件进行计算，如reactant-product.xtd。
赞一下 回复此楼
8楼2016-06-17 11:08:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaojivan 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 362求调剂一志愿中国石油大学 +4 我要考大 2026-04-06 6/300 2026-04-06 14:11 by 无际的草原
[考研] 工科370求调剂 +3 溏心煎鸡蛋 2026-04-05 3/150 2026-04-06 10:55 by 这是一个无聊的�
[考研] 求调剂，一志愿郑州大学材料与化工专硕，英二数二342分，求老师收留 +19 v12abo 2026-04-02 21/1050 2026-04-06 09:29 by 蓝云思雨
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 22:23 by hemengdong
[考研] 求调剂 +11 熊二想上岸 2026-04-04 11/550 2026-04-05 22:21 by 醉翁wl
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:29 by 啵啵啵0119
[考研] 22408 总分320，一篇论文二作，两个国三，求调剂 +3 Leomulufu 2026-04-04 5/250 2026-04-05 19:04 by chongya
[考研] 318求调剂 +11 ykyhsa 2026-04-05 13/650 2026-04-05 12:44 by aidndnjck
[考研] 一志愿江南大学085501机械工程专硕326分，本科佳木斯大学 +5 顾若浮生 2026-04-03 9/450 2026-04-05 09:57 by 1753564080
[考研] 0854求调剂 +4 assdll 2026-04-03 4/200 2026-04-04 22:17 by hemengdong
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 一志愿085404，总分291，四级已过，求调剂 +5 阿俊阿俊阿俊 2026-04-04 7/350 2026-04-04 13:23 by 莲菜就是藕吧
[考研] 282求调剂 不挑专业 求收留 +7 Yam. 2026-03-30 8/400 2026-04-03 14:12 by zhangdingwa
[考研] 求材料调剂 一志愿南昌大学 328分 +5 yyy..... 2026-04-03 5/250 2026-04-03 13:46 by 百灵童888
[考研] 生物学308分求调剂（一志愿华东师大） +6 相信必会光芒万� 2026-03-31 7/350 2026-04-02 23:16 by JourneyLucky
[考研] 07生物学求调剂 一志愿同济大学359分 +3 LAMC. 2026-03-30 3/150 2026-04-02 10:26 by 18828373951
[考研] 环境工程调剂 +9 hyzzzzzzz. 2026-04-01 9/450 2026-04-01 14:20 by salamander`
[考研] 262求调剂 +9 励志一定发文章 2026-03-31 10/500 2026-04-01 12:22 by sunshine0013
[考研] 材料调剂 +10 Eujd1 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:23 by ivanqyq
[考研] 一志愿食品科学与工程083200求调剂 +4 XQTJZ 2026-03-30 4/200 2026-03-31 04:10 by fmesaito
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭