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yangaihong

银虫 (小有名气)

[求助] 关于晶体B类错误 已有2人参与

投出去一篇文章,回来的修改意见中有一条要求修改cif文件中的B类错误,但是如果把检查报告中的B类错误修改之后,感觉数据也不是太合理,所以就不想改数据了,想求那位大侠帮忙给编辑解释一下,看看这种情况怎么给编辑回信比较好?谢啦
Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O27 Check
D-H Without Acceptor O23 - H23A ... Please Check
关于晶体B类错误
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一个问题,氧原子加氢问题。一般氧原子加氢需要在残余峰里找到合适的。如果你找不到合适的残余峰(考虑键长和键角是否合适),这种情况是可以不用加氢的,因为加不上合适的氢原子。
第二个问题,是H23A没有跟其它氧或者氮原子形成氢键。如果这个氧原子(或者水分子)本身无序,或者周围的氧原子有无序的,就可以用无序来解释。如果没有无序问题,你就需要重新精修O23上的氢原子,或者对这对氢原子做出一些限制,看是否能够产生氢键。
老歪博
5楼2014-03-01 05:49:49
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yangaihong: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢您的帮助! 2014-04-09 07:09:08
你可以和编辑说你的氧原子高度无序,没有办法加氢。不过还是建议加上,实在不行就SQUEEZE。
学无止境
2楼2014-02-28 00:43:45
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yangaihong

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cluster8676 at 2014-02-28 00:43:45
你可以和编辑说你的氧原子高度无序,没有办法加氢。不过还是建议加上,实在不行就SQUEEZE。

谢谢,那第二个问题怎么回答呢?
3楼2014-02-28 15:15:04
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by yangaihong at 2014-02-27 19:15:04
谢谢,那第二个问题怎么回答呢?...

第二个是氢键没有受体原子,你可以找到原因解释一下,如果是溶剂水的话其实可以和第一个问题一起回答。
学无止境
4楼2014-03-01 00:27:47
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