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z_xiang

铁虫 (小有名气)

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[求助] 16SrRNA测序结果，各位看看什么意思已有1人参与

本人非微生物专业。通过16SrRNA测序结果得到：
      domain Bacteria  (0/20/1255860)
         phylum "Actinobacteria"  (0/20/183296)
               class Actinobacteria  (0/20/183296)
                  subclass Actinobacteridae  (0/20/173032)
                     order Actinomycetales  (0/20/171746)
                           suborder Streptomycineae  (0/20/10855)
                              family Streptomycetaceae  (0/20/10855)
                                 genus Streptomyces  (0/20/10490)
S000362381    not_calculated 1.000 1246  Streptomyces sp. 86; AY582722
S000426678    not_calculated 1.000 1299  Streptomyces sp. N0014; AY754707
S000691624    not_calculated 1.000 1242  Streptomyces sp. a16; DQ513513
S000691630    not_calculated 1.000 1243  Streptomyces sp. w3; DQ513519
S000927142    not_calculated 1.000 1304  Streptomyces sp. SOK2/15-04; EU098021
S000967392    not_calculated 1.000 1219  Streptomyces sp. TPBF16; EU249600
S000981683    not_calculated 1.000 1306  Streptomyces sp. A152 Ydz-ZZ; EU368800

结果应该是属于链霉菌属。下面的S000362381    not_calculated 1.000 1246  Streptomyces sp. 86; AY582722是什么意思？Streptomyces sp. 86是什么菌种？ BLAST后不是应该有和相近菌株的相似度吗？如何获得，谢谢！

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1楼 2014-02-18 20:02:16

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dllchina

木虫 (著名写手)

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