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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 16SrRNA测序有结果，就说明是单菌吗？
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小嫩瓜

木虫 (小有名气)

[求助] 16SrRNA测序有结果，就说明是单菌吗？

本人分离菌的时候不能确定是否为单菌，16S测序能测出结果，这能说明我筛的菌一定为单菌吗？有知道的人回答一下吧！在此谢过了！
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活的艰辛是因为执着和不放弃
1楼 2012-04-11 15:55:00
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tdong06

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小嫩瓜: 金币+1 2012-04-12 10:09:08
肯定不可以的，你的纯化都没有搞定，后面的结果怎么能确定呢？
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2楼2012-04-11 20:06:22
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wangcui2003

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+3, xinchong jiayou 2012-04-11 23:43:28
小嫩瓜: 金币+1 2012-04-12 10:09:26
首先应该在显微镜下看菌落形态是否一致，再根据测序的结果，如果覆盖率在97%以上，相似率在99%以上，应该可以确定为单菌了。
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坚持就是胜利！
3楼2012-04-11 21:45:59
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-11 23:43:34
小嫩瓜: 金币+1 2012-04-12 10:09:43
这都是问题吗，你自己纯化的菌，你自己都搞不清纯了没有，还去测序，多次转接，菌落形态单一，不要在被污染了
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4楼2012-04-11 21:54:49
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千丶百度

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小嫩瓜: 金币+2 2012-04-12 18:02:56
挑单克隆多转接几次应该就可以了吧？16S测序是为了鉴定菌种的
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5楼2012-04-12 16:31:43
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www790501

铜虫 (小有名气)
★
zhang8826857: 金币+1, guli 2012-04-13 22:41:20
只能说有可能是单菌，因为一般情况下如果是混菌16s测序会产生信号双峰所以测不出的；但也有另一种可能，恰好混菌中只有一株能正常扩出16s，其它菌没有扩出，那么测出的单一的16S序列也不能说明菌是纯的。这是我个人理解。
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6楼2012-04-12 23:16:02
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白小铁

铁虫 (初入文坛)
一般情况下，没有出现套峰基本可以判断是单菌。但只能说明挑到的样可能是单菌。
不过楼主，判断是不是单菌，从形态学就可以看出来吧。。。
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7楼2012-04-12 23:28:35
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我叫路人甲

银虫 (小有名气)
16S 测序回来你看一下是不是单峰，如果不是单克隆的话他的峰是双峰或者更乱。。。
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8楼2012-04-12 23:37:48
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小嫩瓜

木虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 我叫路人甲 at 2012-04-12 23:37:48:
16S 测序回来你看一下是不是单峰，如果不是单克隆的话他的峰是双峰或者更乱。。。

是单峰
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活的艰辛是因为执着和不放弃
9楼2012-04-13 08:53:32
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girlfisher

金虫 (小有名气)
还不好说，如果污染得细菌数量很少的话
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10楼2012-04-13 12:10:49
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