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小嫩瓜

木虫 (小有名气)

[求助] 16SrRNA测序有结果,就说明是单菌吗?

本人分离菌的时候不能确定是否为单菌,16S测序能测出结果,这能说明我筛的菌一定为单菌吗?有知道的人回答一下吧!在此谢过了!
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活的艰辛是因为执着和不放弃
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tdong06

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小嫩瓜: 金币+1 2012-04-12 10:09:08
肯定不可以的,你的纯化都没有搞定,后面的结果怎么能确定呢?
2楼2012-04-11 20:06:22
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wangcui2003

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+3, xinchong jiayou 2012-04-11 23:43:28
小嫩瓜: 金币+1 2012-04-12 10:09:26
首先应该在显微镜下看菌落形态是否一致,再根据测序的结果,如果覆盖率在97%以上,相似率在99%以上,应该可以确定为单菌了。
坚持就是胜利!
3楼2012-04-11 21:45:59
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-11 23:43:34
小嫩瓜: 金币+1 2012-04-12 10:09:43
这都是问题吗,你自己纯化的菌,你自己都搞不清纯了没有,还去测序,多次转接,菌落形态单一,不要在被污染了
4楼2012-04-11 21:54:49
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千丶百度

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小嫩瓜: 金币+2 2012-04-12 18:02:56
挑单克隆多转接几次应该就可以了吧?16S测序是为了鉴定菌种的
5楼2012-04-12 16:31:43
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www790501

铜虫 (小有名气)


zhang8826857: 金币+1, guli 2012-04-13 22:41:20
只能说有可能是单菌,因为一般情况下如果是混菌16s测序会产生信号双峰所以测不出的;但也有另一种可能,恰好混菌中只有一株能正常扩出16s,其它菌没有扩出,那么测出的单一的16S序列也不能说明菌是纯的。这是我个人理解。
6楼2012-04-12 23:16:02
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白小铁

铁虫 (初入文坛)

一般情况下,没有出现套峰基本可以判断是单菌。但只能说明挑到的样可能是单菌。
不过楼主,判断是不是单菌,从形态学就可以看出来吧。。。
7楼2012-04-12 23:28:35
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我叫路人甲

银虫 (小有名气)

16S 测序回来你看一下是不是单峰,如果不是单克隆的话他的峰是双峰或者更乱。。。
8楼2012-04-12 23:37:48
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小嫩瓜

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 我叫路人甲 at 2012-04-12 23:37:48:
16S 测序回来你看一下是不是单峰,如果不是单克隆的话他的峰是双峰或者更乱。。。

是单峰
活的艰辛是因为执着和不放弃
9楼2012-04-13 08:53:32
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girlfisher

金虫 (小有名气)

还不好说,如果污染得细菌数量很少的话
10楼2012-04-13 12:10:49
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