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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 16SrRNA测序结果，各位看看什么意思
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z_xiang

铁虫 (小有名气)

[求助] 16SrRNA测序结果，各位看看什么意思 已有1人参与

本人非微生物专业。通过16SrRNA测序结果得到：
         domain Bacteria  (0/20/1255860)
             phylum "Actinobacteria"  (0/20/183296)
                 class Actinobacteria  (0/20/183296)
                     subclass Actinobacteridae  (0/20/173032)
                         order Actinomycetales  (0/20/171746)
                             suborder Streptomycineae  (0/20/10855)
                                 family Streptomycetaceae  (0/20/10855)
                                     genus Streptomyces  (0/20/10490)
S000362381     not_calculated 1.000 1246  Streptomyces sp. 86; AY582722
S000426678     not_calculated 1.000 1299  Streptomyces sp. N0014; AY754707
S000691624     not_calculated 1.000 1242  Streptomyces sp. a16; DQ513513
S000691630     not_calculated 1.000 1243  Streptomyces sp. w3; DQ513519
S000927142     not_calculated 1.000 1304  Streptomyces sp. SOK2/15-04; EU098021
S000967392     not_calculated 1.000 1219  Streptomyces sp. TPBF16; EU249600
S000981683     not_calculated 1.000 1306  Streptomyces sp. A152 Ydz-ZZ; EU368800

结果应该是属于链霉菌属。下面的S000362381     not_calculated 1.000 1246  Streptomyces sp. 86; AY582722是什么意思？Streptomyces sp. 86是什么菌种？ BLAST后不是应该有和相近菌株的相似度吗？如何获得，谢谢！
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1楼 2014-02-18 20:02:16
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
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2楼2014-02-19 12:27:00
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