24小时热门版块排行榜    

查看: 1205  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ecowkx

铜虫 (初入文坛)

[求助] 高斯优化反应物出现的错误 已有2人参与

对同一蛋白体系进行优化十个构象只有其中一种构象总是出现错误不能运行

        Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.215863     0.002500     NO
RMS     Force            0.036181     0.001667     NO
Maximum Displacement     ********     0.010000     NO
RMS     Displacement     1.283959     0.006667     NO
Maximum MM Force         0.215056     0.002500     NO
RMS     MM Force         0.024384     0.001667     NO
位移无限大不能显示,求遇到过这种问题的高手帮忙!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ecowkx

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-02-18 07:39:40
如果没有出现错误,也不好判断,可能后台正在运行,看下CPU使用率,再对比一下已经算好的几个循环中的各个数据的走势。
既然你可以算,输入文件应是没有问题。另外你用了scf=qc,可能会耗时久一点。

只能完成一个循环,然后任务就停掉了,是不是有可能初始结构本来就不合理。。。。。
5楼2014-02-18 18:29:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

gengle

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没到遇过这个错误,建议LZ多给出一些信息,至少要把出错信息贴上来。
只是这样感觉不好判断。
2楼2014-02-17 23:29:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ecowkx

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gengle at 2014-02-17 23:29:37
没到遇过这个错误,建议LZ多给出一些信息,至少要把出错信息贴上来。
只是这样感觉不好判断。

log文件最后没有出错信息,感觉就是计算不能进行下去,每次都只能运行20分钟左右。。。。。。
脚本如下
#p opt=loose oniom(b97d/6-31g(d):amber=hardfirst) nosymm geom=connectivity gfinput iop(2/15=3,6/7=3,2/11=1) test pop=mk scf=qc
3楼2014-02-17 23:44:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2014-02-19 10:36:54
如果没有出现错误,也不好判断,可能后台正在运行,看下CPU使用率,再对比一下已经算好的几个循环中的各个数据的走势。
既然你可以算,输入文件应是没有问题。另外你用了scf=qc,可能会耗时久一点。
4楼2014-02-18 07:39:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 3/150 2026-11-02 01:00 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 4/200 2026-11-02 00:50 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 11/550 2026-11-02 00:21 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 8/400 2026-11-02 00:21 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +6 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-02 00:11 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 23:55 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 15/750 2026-11-01 23:45 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:27 by xzcv0Tehd8lQ
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 22:05 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 22:01 by xzcv0Tehd8lQ
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 16/800 2026-11-01 21:19 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 15/750 2026-11-01 16:52 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:48 by BCdvBAEpt3zm
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:45 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 14:48 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 4/200 2026-11-01 11:01 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 2027博士申请-临床检验诊断学、病原生物学、微生物方向 50+3 yyh@ 2026-10-28 4/200 2026-10-31 12:47 by 可淡不可忘
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
信息提示
请填处理意见