应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 进行过渡态计算时link died
111/2返回列表12下一页
查看: 2833  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

nedved33

金虫 (小有名气)

[求助] 进行过渡态计算时link died

本人新手，刚接触高斯半个月，第一次算过渡态，用的是QST2方法，反应物和产物的结构都已优化，出错文件见下图，请问是不是因为没收敛才出错的？求各位高手帮忙解答下，谢谢啦
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-04-19 20:01:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有2个 )

nedved33

金虫 (小有名气)
nedved33: 回帖置顶 2012-04-21 18:51:34
引用回帖:
3楼: Originally posted by 书万里 at 2012-04-20 18:56:04:
晕，你这种求助方式，神想帮你也都没办法。

你把out文件中的错误提示贴出来呗。

也没有错误提示，link就死了
最后几行是这样的，
Harris functional with IExCor=  402 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 2.20D-02 ExpMax= 8.59D+03 ExpMxC= 1.30D+03 IAcc=3 IRadAn=         0 AccDes= 0.00D+00
HarFok:  IExCor=  402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         0 IDoV= 1
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=           0
         NFxFlg=           0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
         Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl=     500 IOpCl=  0
         NMat0=    1 NMatS0=    1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
         I1Cent=           4 NGrid=           0.
Petite list used in FoFCou.
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on             energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
EnCoef did     3 forward-backward iterations
EnCoef did    10 forward-backward iterations
EnCoef did     6 forward-backward iterations
EnCoef did     3 forward-backward iterations
EnCoef did     5 forward-backward iterations
EnCoef did     3 forward-backward iterations
Restarting incremental Fock formation.
Restarting incremental Fock formation.
Restarting incremental Fock formation.
Restarting incremental Fock formation.
Restarting incremental Fock formation.
SCF Done:  E(RB3LYP) =  -1292.61725385     A.U. after  115 cycles
             Convg  =    0.6621D-08             -V/T =  2.3657

然后我看了四个收敛判据，都是NO
Item               Value                    Threshold                      Converged?
Maximum Force            ********     0.000450     NO
RMS     Force            2.373340     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.314813     0.001800     NO
RMS     Displacement     0.071534     0.001200     NO
Predicted change in Energy=-7.676819D+00
请问这样子该怎么办？
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-21 17:03:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nedved33

金虫 (小有名气)
nedved33: 回帖置顶 2012-04-21 18:51:41
引用回帖:
4楼: Originally posted by 一起来化学 at 2012-04-20 21:10:28:
没有out文件还真是爱莫能助。。。。。。

不好意思啊，原帖不能编辑，只能把output文件在上个楼层
我想做的是工作是寻找氢质子从O转移到N上这个过程的过渡态，如下图所示




input文件是这样的：

%chk=qst2-benzamide+H(O-N).chk
%mem=512MB
# opt=(calcfc,qst2) freq=noraman b3lyp/gen geom=connectivity

benzamide+H(O)

1 1
C                  1.11301600   -1.43574500   -1.10552100
C                  2.41360500   -1.92999500   -0.85121800
C                  2.62578000   -1.95770300    0.56003500
C                  0.49176400   -1.17830700    0.17683300
C                  1.46462000   -1.47790900    1.20542200
C                  1.74452800    2.04146000    0.11530200
C                  2.27496800    1.75721600   -1.17695900
C                  3.57564900    1.20099600   -0.99963800
C                  2.70907300    1.65631900    1.09016900
C                  3.84312700    1.13892600    0.39800200
Fe                 2.16615200    0.00261500   -0.05545000
H                  0.68014800   -1.29263000   -2.08419400
H                  3.13591500   -2.20574200   -1.60337000
H                  3.53555400   -2.26228700    1.05318900
H                  1.30360000   -1.38793800    2.26731500
H                  1.78325400    1.93090800   -2.12165600
H                  4.23400300    0.86441400   -1.78562500
H                  2.59877100    1.73417700    2.16055400
H                  4.73800000    0.74418200    0.85374100
H                  0.77345400    2.46438400    0.32411700
C                 -0.82977900   -0.69824100    0.41918400
O                 -1.13218600   -0.35342200    1.65213200
N                 -1.75633100   -0.63437300   -0.53092300
H                 -1.50900000   -1.00882000   -1.43818700
C                 -3.10520600   -0.15643500   -0.33244000
C                 -4.16366500   -1.06336800   -0.40635000
C                 -3.33065600    1.20179200   -0.09599500
C                 -5.46554300   -0.59902200   -0.23819300
H                 -3.96961300   -2.11354700   -0.59159200
C                 -4.63790300    1.65029100    0.08546300
H                 -2.50109900    1.89959600   -0.07955200
C                 -5.70164900    0.75276400    0.01217700
H                 -6.29354900   -1.29468400   -0.29829000
H                 -4.82285900    2.70196700    0.26695700
H                 -6.71661600    1.10738100    0.14481200
H                 -2.06848400   -0.09960200    1.73524100

1 2 1.5 4 1.0 12 1.0
2 3 1.5 13 1.0
3 5 1.5 14 1.0
4 5 1.5 21 1.5
5 15 1.0
6 7 1.5 9 1.5 20 1.0
7 8 1.5 16 1.0
8 10 1.5 17 1.0
9 10 1.5 18 1.0
10 19 1.0
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21 22 1.5 23 1.5
22 36 1.0
23 24 1.0 25 1.0
24
25 26 1.5 27 1.5
26 28 1.5 29 1.0
27 30 1.5 31 1.0
28 32 1.5 33 1.0
29
30 32 1.5 34 1.0
31
32 35 1.0
33
34
35
36

benzamide+H(N)

1 1
C                  1.21288800   -1.36099700   -1.24217200
C                  2.58706900   -1.66658000   -1.10427900
C                  2.87805500   -1.85849200    0.27920400
C                  0.63003400   -1.39551100    0.08688800
C                  1.69230900   -1.68162000    1.02452900
C                  1.32131200    1.96076500    0.44791200
C                  1.86491000    1.96472500   -0.87130600
C                  3.24292000    1.61089700   -0.77537300
C                  2.35716900    1.59927200    1.35612300
C                  3.54568100    1.38719900    0.59815100
Fe                 2.06932600    0.06751900   -0.02672100
H                  0.71276900   -1.19126600   -2.18382600
H                  3.29949300   -1.71779000   -1.91271500
H                  3.85129900   -2.07354600    0.69197900
H                  1.57483600   -1.76131400    2.09338300
H                  1.33842600    2.20593700   -1.78234800
H                  3.93152500    1.51116700   -1.60017600
H                  2.25718400    1.49560200    2.42535500
H                  4.50316800    1.08507400    0.99342400
H                  0.30091700    2.18476900    0.72176500
C                 -0.70664500   -1.09670700    0.49779600
O                 -1.26561800   -1.09054400    1.53607400
N                 -1.66210500   -0.70716200   -0.81526800
H                 -1.75978100   -1.56150100   -1.36906400
C                 -2.98091900   -0.16578000   -0.46997400
C                 -4.01189900   -1.04536000   -0.16404800
C                 -3.14997700    1.21320900   -0.42753900
C                 -5.25456400   -0.52166700    0.18378400
H                 -3.85739800   -2.11862500   -0.18924000
C                 -4.39743500    1.72415800   -0.07859000
H                 -2.33242600    1.88477500   -0.66895600
C                 -5.44624500    0.85828200    0.22707500
H                 -6.06962900   -1.19367700    0.42184100
H                 -4.54788100    2.79617000   -0.04870400
H                 -6.41518700    1.25984400    0.49742700
H                 -1.13810300   -0.04138500   -1.38621300

1 2 1.5 4 1.0 12 1.0
2 3 1.5 13 1.0
3 5 1.5 14 1.0
4 5 1.5 21 1.5
5 15 1.0
6 7 1.5 9 1.5 20 1.0
7 8 1.5 16 1.0
8 10 1.5 17 1.0
9 10 1.5 18 1.0
10 19 1.0
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21 22 2.0
22
23 24 1.0 25 1.0 36 1.0
24
25 26 1.5 27 1.5
26 28 1.5 29 1.0
27 30 1.5 31 1.0
28 32 1.5 33 1.0
29
30 32 1.5 34 1.0
31
32 35 1.0
33
34
35
36

C O N H 0
6-311+G(d,p)
****
Fe 0
lanl2dz
****

Fe 0
lanl2dz
赞一下 回复此楼
6楼2012-04-21 17:14:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

nedved33

金虫 (小有名气)
这贴不会就这么沉了吧。。。。。。。。
赞一下 回复此楼
2楼2012-04-20 18:18:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2012-04-20 21:59:56
晕，你这种求助方式，神想帮你也都没办法。

你把out文件中的错误提示贴出来呗。
赞一下 回复此楼
喂人民服雾。
3楼2012-04-20 18:56:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一起来化学

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没有out文件还真是爱莫能助。。。。。。
赞一下 回复此楼
大家多多交流
4楼2012-04-20 21:10:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
nedved33: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-04-21 17:59:22
1，将gen改为genecp。
2，freq=noraman改为freq。DFT的raman不是默认的。
3，这种质子转移，个人建议用TS。
赞一下 回复此楼
喂人民服雾。
7楼2012-04-21 17:31:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nedved33

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 书万里 at 2012-04-21 17:31:02:
1，将gen改为genecp。
2，freq=noraman改为freq。DFT的raman不是默认的。
3，这种质子转移，个人建议用TS。

按您的方法先运行上了，
不过还是有点疑问
genecp和gen有什么区别，是不是使用genecp基组就不用写pseudo=read这个关键词了
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-21 18:02:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

【答案】应助回帖

★ ★
nedved33: 金币+2, ★★★很有帮助, 呵呵，以前都是看别人的输入文件瞎弄的，现在终于明白意思了，谢谢解答啊 2012-04-21 18:55:13
引用回帖:
8楼: Originally posted by nedved33 at 2012-04-21 18:02:12:
按您的方法先运行上了，
不过还是有点疑问
genecp和gen有什么区别，是不是使用genecp基组就不用写pseudo=read这个关键词了

genecp是等价于pseudo=read。

gen可以用来自定义基组，genecp是其变体，用在有赝势基组的情况。
赞一下 回复此楼
喂人民服雾。
9楼2012-04-21 18:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控
晕，不要称您，受不起。我也是初学者，说错了，见谅。
赞一下 回复此楼
喂人民服雾。
10楼2012-04-21 18:21:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nedved33 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 小木虫没落了，除了祈祷帖子，几乎看不到有价值的帖子 +14 botar 2026-07-14 15/750 2026-07-19 00:15 by beefly
[基金申请] 面上的水很深 +13 布布和一二 2026-07-18 18/900 2026-07-18 20:37 by 日月天地
[基金申请] 国社科通讯评审 +4 潜水冠军123 2026-07-18 5/250 2026-07-18 19:58 by chenmodeyu
[基金申请] 5个%2F，非固定段22个字母 +8 jaasxulu 2026-07-15 9/450 2026-07-18 17:40 by dxcgbm
[基金申请] 生命口C13面上会评时间 +7 luckinging 2026-07-14 11/550 2026-07-17 20:43 by 虫卜1988
[教师之家] 内心匮乏 +16 水冰月月野兔 2026-07-12 16/800 2026-07-17 19:25 by otani
[基金申请] 生命口面上会评结束了吗大家有知道结果吗？现在还没有结果正常不？ +6 碧水00 2026-07-16 9/450 2026-07-17 15:21 by jaasxulu
[论文投稿] 投英文期刊如何查重 10+5 不知道取什么名� 2026-07-15 6/300 2026-07-17 09:07 by bobvan
[基金申请] 不要再数国自然申请书的 filecode 的分隔符个数了 +14 sadpencil 2026-07-12 21/1050 2026-07-17 00:15 by wangze12014
[有机交流] 伯胺上甲基求助 100+4 002tmumu 2026-07-14 7/350 2026-07-16 19:47 by 002tmumu
[论文投稿] 跨出版社商投稿 20+5 倪好520 2026-07-13 5/250 2026-07-16 17:24 by 无视军团
[基金申请] 生生命学部会评 +4 wuke100666 2026-07-15 4/200 2026-07-16 00:12 by 啦啦小妮子
[基金申请] H口，面上，时间戳7月7日。 +3 plumage5 2026-07-15 3/150 2026-07-15 21:06 by 6543yes
[基金申请] 会评 +5 无名者登山 2026-07-15 5/250 2026-07-15 18:15 by 杠就是你对
[基金申请] E口会评 +11 布布和一二 2026-07-13 13/650 2026-07-15 16:34 by Kittylucky
[基金申请] E口青C会评结束了吗？ 40+3 小小书虫c 2026-07-14 9/450 2026-07-15 16:04 by 安静的知了
[论文投稿] 农业机械学报投稿周期 +3 G0DLIN 2026-07-14 7/350 2026-07-15 09:26 by xs74101122
[基金申请] 国自然面上D口祈祷 +4 monkeynana 2026-07-14 4/200 2026-07-15 09:14 by 白水煮
[基金申请] 没收到消息，再次陪跑 +3 天空星辰fly 2026-07-14 3/150 2026-07-14 19:14 by 6543yes
[基金申请] 明天E口面上会评 +8 布布和一二 2026-07-12 9/450 2026-07-13 22:59 by QTSorange
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭