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ecowkx

铜虫 (初入文坛)

[求助] 高斯优化反应物出现的错误 已有2人参与

对同一蛋白体系进行优化十个构象只有其中一种构象总是出现错误不能运行

        Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.215863     0.002500     NO
RMS     Force            0.036181     0.001667     NO
Maximum Displacement     ********     0.010000     NO
RMS     Displacement     1.283959     0.006667     NO
Maximum MM Force         0.215056     0.002500     NO
RMS     MM Force         0.024384     0.001667     NO
位移无限大不能显示,求遇到过这种问题的高手帮忙!
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gengle

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没到遇过这个错误,建议LZ多给出一些信息,至少要把出错信息贴上来。
只是这样感觉不好判断。
2楼2014-02-17 23:29:37
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ecowkx

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gengle at 2014-02-17 23:29:37
没到遇过这个错误,建议LZ多给出一些信息,至少要把出错信息贴上来。
只是这样感觉不好判断。

log文件最后没有出错信息,感觉就是计算不能进行下去,每次都只能运行20分钟左右。。。。。。
脚本如下
#p opt=loose oniom(b97d/6-31g(d):amber=hardfirst) nosymm geom=connectivity gfinput iop(2/15=3,6/7=3,2/11=1) test pop=mk scf=qc
3楼2014-02-17 23:44:35
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2014-02-19 10:36:54
如果没有出现错误,也不好判断,可能后台正在运行,看下CPU使用率,再对比一下已经算好的几个循环中的各个数据的走势。
既然你可以算,输入文件应是没有问题。另外你用了scf=qc,可能会耗时久一点。
4楼2014-02-18 07:39:40
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ecowkx

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-02-18 07:39:40
如果没有出现错误,也不好判断,可能后台正在运行,看下CPU使用率,再对比一下已经算好的几个循环中的各个数据的走势。
既然你可以算,输入文件应是没有问题。另外你用了scf=qc,可能会耗时久一点。

只能完成一个循环,然后任务就停掉了,是不是有可能初始结构本来就不合理。。。。。
5楼2014-02-18 18:29:41
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ecowkx at 2014-02-18 18:29:41
只能完成一个循环,然后任务就停掉了,是不是有可能初始结构本来就不合理。。。。。...

如果是这种情况的话应该会内坐标错误的。我觉得还是要先通过一些途径确定是停掉了
6楼2014-02-19 07:46:08
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