24小时热门版块排行榜    

查看: 1600  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

churchill87426

木虫 (正式写手)

[求助] 如何检测短片段DNA与哪些蛋白结合? 已有4人参与

小弟在克隆启动子时发现某个癌细胞的启动子与正常细胞启动子相比有一段缺失,长度大约是25bp。而这个启动子对应的蛋白在癌细胞里面高表达。
小弟很好奇这段25bp的DNA是不是和某个蛋白结合,然后抑制了正常细胞里面该蛋白的表达;而癌细胞里面缺失这25bp,因此该蛋白高表达?
所以小弟很想知道这25bp能和那些蛋白相互结合。求大神赐教检测方法。
之前有朋友介绍用酵母单杂交,但由于片段比较短,不知道可行否?
求大神们赐教,谢谢!!!
无论是生物信息学的方法,还是分子生物学方法都可以,谢谢了!

[ Last edited by silicare on 2014-2-17 at 15:04 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy656691

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-04-03 00:04:50
先做酵母单杂交看看能不能结合,能够结合的话再花钱买个试剂盒做EMSA实验。
5楼2014-04-02 17:48:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-02-18 11:50:56
churchill87426: 金币+10, ★★★很有帮助, 那怎么知道结合的蛋白是啥? 2014-04-02 22:22:06
做gel shift吧,跑page,做northern杂短片段DNA,与蛋白结合的应该跑得慢点。能否多给几枚金币给我,我缺这玩意儿。
2楼2014-02-17 12:40:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaolong11a

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-02-18 11:50:59
churchill87426: 金币+40, 那用什么蛋白拉呢?ChIP只能知道蛋白和那些DNA结合,我怎么确定这个蛋白? 2014-04-02 22:22:51
做染色质免疫共沉淀(ChIP),将蛋白拉下来后,做质谱检测
多情总被无情扰。。。愁
3楼2014-02-17 12:41:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-02-18 11:51:03
15%的PGE胶能够做更小的RNA10-30nt大小的,我说的肯定正确!
4楼2014-02-17 12:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +11 kulium 2026-08-21 14/700 2026-08-24 02:12 by 流流伤
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +4 炎黄贵胄 2026-08-22 5/250 2026-08-24 02:09 by 流流伤
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见