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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸杂交 » 如何检测短片段DNA与哪些蛋白结合？
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churchill87426

木虫 (正式写手)

[求助] 如何检测短片段DNA与哪些蛋白结合？已有4人参与

小弟在克隆启动子时发现某个癌细胞的启动子与正常细胞启动子相比有一段缺失，长度大约是25bp。而这个启动子对应的蛋白在癌细胞里面高表达。
小弟很好奇这段25bp的DNA是不是和某个蛋白结合，然后抑制了正常细胞里面该蛋白的表达；而癌细胞里面缺失这25bp，因此该蛋白高表达？
所以小弟很想知道这25bp能和那些蛋白相互结合。求大神赐教检测方法。
之前有朋友介绍用酵母单杂交，但由于片段比较短，不知道可行否？
求大神们赐教，谢谢！！！
无论是生物信息学的方法，还是分子生物学方法都可以，谢谢了！

[ Last edited by silicare on 2014-2-17 at 15:04 ]
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1楼2014-02-16 22:51:10
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churchill87426

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xy656691 at 2014-04-02 17:48:50
先做酵母单杂交看看能不能结合，能够结合的话再花钱买个试剂盒做EMSA实验。

主要不知道有哪些候选蛋白，所以无从下手。。
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7楼2014-04-02 22:37:42
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