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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 基因序列优化办法
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胡萝卜呀

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因序列优化办法 已有4人参与

比如现在需要在线虫细胞中表达一段老鼠的蛋白，那么需要把这段基因序列做一些修饰，在翻译氨基酸序列不变的情况下，利用一些同义密码子替换原有密码子。我们构建基因时，要在氨基酸序列不变的情况下，选择该宿主细胞的偏嗜密码子。但具体如何知道线虫的偏嗜密码子？
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1楼 2014-02-16 00:02:54
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胡萝卜呀

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by carl629 at 2014-02-19 21:41:54
http://www.kazusa.or.jp/codon/ 从这个网站上能查到很多物种的密码子使用频率，选择其中高频率的密码子进行优化即可

谢谢你啦~！
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10楼2014-03-12 13:07:36
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sdcavell

铁杆木虫 (职业作家)
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 应助指数-1, 违规存档, 沙发可以，别选应助 2014-02-16 09:04:19
抢个沙发！问题太高深，请后面的回答

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ILOVEYOU!
2楼2014-02-16 06:40:21
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
好像有软件的，你查查看！
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3楼2014-02-16 22:53:02
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carl629

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-02-18 11:49:09
这方面我正好也做过，有一个网站上有各个物种的密码子使用频率，好像叫codonW还是什么的，明天我发给你

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追寻梦想，一如既往
4楼2014-02-16 23:43:34
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