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胡萝卜呀

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因序列优化办法 已有4人参与

比如现在需要在线虫细胞中表达一段老鼠的蛋白,那么需要把这段基因序列做一些修饰,在翻译氨基酸序列不变的情况下,利用一些同义密码子替换原有密码子。我们构建基因时,要在氨基酸序列不变的情况下,选择该宿主细胞的偏嗜密码子。但具体如何知道线虫的偏嗜密码子?
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sdcavell

铁杆木虫 (职业作家)

感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 应助指数-1, 违规存档, 沙发可以,别选应助 2014-02-16 09:04:19
抢个沙发!问题太高深,请后面的回答

[ 发自小木虫客户端 ]
ILOVEYOU!
2楼2014-02-16 06:40:21
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
好像有软件的,你查查看!
3楼2014-02-16 22:53:02
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carl629

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-02-18 11:49:09
这方面我正好也做过,有一个网站上有各个物种的密码子使用频率,好像叫codonW还是什么的,明天我发给你

[ 发自小木虫客户端 ]
追寻梦想,一如既往
4楼2014-02-16 23:43:34
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huangrui1988

铜虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-13 08:42:55
还可以让公司帮你免费做,只要你过去那边全基因合成。。。。invitrogene可以做。至少
5楼2014-02-17 11:52:46
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胡萝卜呀

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by carl629 at 2014-02-16 23:43:34
这方面我正好也做过,有一个网站上有各个物种的密码子使用频率,好像叫codonW还是什么的,明天我发给你

谢谢你啦~!
6楼2014-02-18 14:22:44
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胡萝卜呀

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by huangrui1988 at 2014-02-17 11:52:46
还可以让公司帮你免费做,只要你过去那边全基因合成。。。。invitrogene可以做。至少

貌似让公司做是要收费的吧
7楼2014-02-18 14:23:45
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huangrui1988

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
7楼: Originally posted by 胡萝卜呀 at 2014-02-18 14:23:45
貌似让公司做是要收费的吧...

收费的是你去做全基因合成,免费的是帮你优化。
8楼2014-02-18 14:51:02
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carl629

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-13 08:43:05
http://www.kazusa.or.jp/codon/ 从这个网站上能查到很多物种的密码子使用频率,选择其中高频率的密码子进行优化即可
追寻梦想,一如既往
9楼2014-02-19 21:41:54
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胡萝卜呀

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by carl629 at 2014-02-19 21:41:54
http://www.kazusa.or.jp/codon/ 从这个网站上能查到很多物种的密码子使用频率,选择其中高频率的密码子进行优化即可

谢谢你啦~!
10楼2014-03-12 13:07:36
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