| 查看: 3396 | 回复: 8 | |||
[交流]
Gaussian 软件的并行效率
|
|
pbs文件里可以指定一个核数，例如 “#PBS -l nodes=1:ppn=8” gjf文件里也可以指定一个核数，例如 " %proc=8" 最近做了一组测试，具体任务为计算单点能 1. pbs=8, gjf=8，运算时间29h 2. pbs=8, gjf=1，运算时间21.5h 3. pbs=1, gjf=8，运算时间26h 4. pbs=1, gjf=1，运算时间36h 由此衍生出两个问题： 1.机器调用的核的数目是由pbs文件决定，还是由gjf文件决定？ 2.高斯的并行效率如何？ ------------------------------------------------------------------------------------- 补充说明一下，我的测试调用的CPU都在一个节点内，没有跨节点并行 [ Last edited by broken1999 on 2014-1-20 at 09:07 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
【211博士招生】环境化学、地学、毒理方向，擅长污染物迁移转化降解、计算模拟者优先
已经有17人回复
-
求助如何利用vasp计算磁光克尔效应
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有213人回复
-
070300总分298求调剂
已经有2人回复
-
26博士申请
已经有0人回复
-
一志愿厦门大学化学学硕307求调剂
已经有19人回复
-
理论与计算化学方向调剂——初试388分（数学144）
已经有2人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
-
投稿期刊求助
已经有1人回复
-
江西师大化学工程学院调剂今晚0点开放！ 缺额100个，速冲！
已经有0人回复
-
图书求助：Fluorescent Probes for Bioactive Species: Design
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gaussian中使用nprocshared 感觉有点儿怪！
已经有4人回复
- 请教并行计算linux的问题
已经有19人回复
- 求助：openmp 单节点多核并行效率问题
已经有4人回复
- 单机多核一个cpu的串行并行求助
已经有26人回复
- 笔记本运行Gaussian,装linux系统能加快计算速度么
已经有16人回复
- 关于Gaussian并行用的TCP-Linda软件及论坛上的Gaussian版本的linda可用性讨论
已经有4人回复
- 回答一些关于Multiwfn的疑问以及未来Multiwfn的发展打算
已经有37人回复
- gaussian 03Revison-E01版在Window 下不能并行计算啊!
已经有9人回复
- 【讨论】Gaussian09的内存控制很奇特？
已经有28人回复
- 【求助】turbomole并行的问题
已经有10人回复
- 【讨论】gaussian算PBC的机子配置问题
已经有8人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
陕科大环境学院招收0857和0830调剂考生【可跨门类，最后2两小时】
+1/200
-
课题组(化学、化工、环境、能源、材料相关方向)欢迎你的加入
+1/186
-
德州学院材料与化工专硕招收大量调剂生
+1/91
-
华南理工大学微电子学院招博士研究生
+1/91
-
物理学调剂
+1/91
-
香港科技大学(广州) CCUS及吸附分离方向全奖博士生，年津贴18万
+1/83
-
坐标上海和长三角 诚征女友
+1/74
-
上海工作，94年的博士
+1/50
-
桂林理工大学物理学专业招收调剂
+1/44
-
北方民族大学085602化学工程有调剂名额58个，欢迎调剂！4月11日报到，12日现场复试
+1/43
-
科研小助理招聘~~~开工啦
+1/35
-
不能理解
+1/28
-
广州大学大湾区环境研究院环境大分子材料研究所王平山教授团队 2026年研究生招生简章
+1/11
-
东北石油大学石油工程学院调剂课题组推荐，欢迎大家联系
+1/9
-
江西师大化学工程学院调剂今晚0点开放！
+1/8
-
中国科学技术大学-安徽大学高薪联合招聘博士后/副研究员
+1/7
-
杭州师范大学-浙江省湿地智慧监测与生态修复重点实验室团队硕士调剂公告
+1/5
-
江苏海洋大学+环境与化学工程学院+课题组招调剂生+第一批调剂
+2/4
-
2026年北京服装学院- 材料学院还有调剂名额，可招收化学材料化工相关专业考研调剂
+1/4
-
07专业方向还有调剂名额
+1/4
2楼2014-01-19 11:50:50
3楼2014-01-19 23:49:57
4楼2014-01-20 05:10:58
5楼2014-01-20 08:48:01
6楼2014-01-20 09:00:23
7楼2014-01-20 14:06:11
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gmy1990: 金币+2 2014-02-11 01:55:22
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gmy1990: 金币+2 2014-02-11 01:55:22
|
这要取决于机器的结构；高斯，完全没有考虑内存关联性，所以比一般的并行程序都差很多。高斯的很多OpenMP并行甚至没有first touch，所以多线程时没法保证内存定域，如果你的集群在节点间使用DSM共享内存，建议你不要使用，除非手动修改代码，否则效果很不理想！ 即使单节点运行，可能的话尽量将内存限制在一个NUMA域上，否则高斯很笨，即使需要的内存不多也会去用NUMA域以外的内存。如果你每个节点有64G，4个numa域，那么可能的话尽量不要给高斯指派超过16G内存，否则可能反而导致变慢。 |
8楼2014-01-20 16:20:32
9楼2014-02-10 09:57:07
