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植物gDNA为模板,PCR前几次出现清晰条带,后面出现涂抹型条带是什么原因?
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LYSH1103
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植物gDNA为模板,PCR前几次出现清晰条带,后面出现涂抹型条带是什么原因?
已有5人参与
我是PCR后进行测序,第一副图是之前的PCR,第二份图是P不出来的图。最后的图片是DNA的质量。体系时50微升的。同KOD酶和普通Taq都是出现相同的现象。求各位指点。
EAT{8376LQXT15[(7[BZ~[9.jpg
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1楼
2014-01-08 23:12:56
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LYSH1103
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专业: 植物遗传学
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6楼
:
Originally posted by
cicelyzh
at 2014-01-09 12:24:13
因为样品里有RNA和其它杂质,可能需要适当增加镁离子浓度或者降低退火温度。...
我在提取DNA的时候已经用过RNase A .其他杂质这个就。。。难弄啦。。。。我用的是降落式PCR程序,55-65度,还要再低点吗?出现问题后我也试过45-55度和50-60度。酶有结果啊。镁离子这个我倒是没有提高。因为我觉得体系没有问题。之前很好啊。对了,我也怀疑过DNA质量,我也新提取了DNA,还是一个样子。。。
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9楼
2014-01-11 20:42:08
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cicelyzh
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★ ★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流
2014-01-09 08:51:59
LYSH1103: 金币+1,
★★★
很有帮助, 我金币太少了,不够分啊,因为是新虫 。。吱吱
2014-01-14 09:46:48
可能是模板用量不正确。而且样品里含有RNA,可能影响引物与模板的结合。
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2楼
2014-01-09 02:14:10
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LYSH1103
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专业: 植物遗传学
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2楼
:
Originally posted by
cicelyzh
at 2014-01-09 02:14:10
可能是模板用量不正确。而且样品里含有RNA,可能影响引物与模板的结合。
我测了我稀释后DNA的浓度,是20-80ng不等。50微升用1微升。
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3楼
2014-01-09 08:07:43
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【答案】应助回帖
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LYSH1103: 金币+1, 我的金币不够啦,,新虫穷啊。。。嘎嘎
2014-01-14 09:47:21
胶和电泳的问题,之前遇到过,一个是胶做的不合适,一个电泳仪设置的有问题,前者的可能性比较大
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4楼
2014-01-09 10:39:21
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