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whqiaoling银虫 (初入文坛)
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CASTEP计算电荷密度和差分电荷密度 已有5人参与
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| 请问用castep计算电荷密度和差分电荷密度时出现提示“Density difference calculation from sets of atoms requires at least one set that has DensityDifference as part of the set name. If there is exactly one such set, then it cannot contain all the atoms. Create correct set(s) to proceed.”是怎么回事？困扰好多天了，求解答。 |
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2楼2017-07-13 14:04:27
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3楼2017-07-13 16:40:25
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先设置定义小分子片段，菜单栏里的Edit/Edit set，点击new，对话框里输入xxx DensityDifference，再点击OK，之后小分子片段是加亮的并被标记。关闭 Edit Sets 对话框。 属于组的原子被一个网罩着，这个网可以被移走。点击该网，选上该组。选在菜单栏里的 View | Explorers | Properties Explorer。在 Properties Explorer 内，把 Filter 的值设为 Set。在 Set 的性质列表里有一项叫做 IsVisible。双击 IsVisible。在 Edit IsVisible 对话框中选择 No / False。按下 OK。 设定的组不在被网罩着。 |
4楼2019-04-24 17:04:12
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【答案】应助回帖
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To compute the fragment density difference you must first define the fragments. You will do this using the Edit Sets option. Begin by creating a set containing the carbon and oxygen atoms. Select Edit | Edit Sets from the menu bar to open the Edit Sets dialog. Click on the carbon atom to select it. Hold down the SHIFT key and click on the oxygen atom. On the Edit Sets dialog, click the New... button to open the Define New Set dialog. Enter the name DensityDifference, click the OK button and close the dialog. In order for CASTEP to recognize the set as a fragment for charge density difference calculations, the name must contain the text string DensityDifference. |
5楼2019-09-26 10:06:01
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