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差分电荷密度的计算 已有2人参与
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| 生成的CHGCAR文件网格下面的数据太大，我把三个系统的数据分别导入到excel中相减，但由于数据太多，excel中只能导入一部分，无法全部倒入或不能导入，这样肯定结果不全，我想问前辈有什么方法吗？谢谢！ |
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hn19870519
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2楼2011-10-22 23:22:16
hn19870519
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【答案】应助回帖
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youzhizhe(金币+1): 建议直接上传附件。谢谢交流。 2011-10-22 23:43:38
youzhizhe(金币+1): 建议直接上传附件。谢谢交流。 2011-10-22 23:43:38
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subroutine chgdiff !################################################ !DMol3 total electron density !(1p,e12.5) ! 9.000 8.200 9.400 90.000 90.000 90.000 ! 45 41 47 ! 1 -23 22 -20 21 -22 25 !################################################# !initializing all paremeters implicit none integer :: NGX,NGY,NGZ real*8 :: amod,bmod,cmod,alpha,beta,gamma,VOL real*8 :: scale real*8,allocatable :: a(  ,b(,c(real*8,allocatable :: atomnum( real*8,allocatable :: chgdata1(:,:, ,chgdata2(:,:,integer :: i,j,k,n,m,iserror,p open(11,file='CHGCAR1',form='formatted',status='old',iostat=iserror) open(13,file='CHGCAR2',form='formatted',status='old',iostat=iserror) if(iserror>0) then write(*,*)"The CHGCAR file does not exist, please try again!" stop endif !读入原子种类数量 write(*,*)"---------------------------------" write(*,*)"Please input atomic species amount: " read(*,*)n !read initialized paremeters and discard head sections read(11,*) read(11,*)scale allocate(a(3)) allocate(b(3)) allocate(c(3)) allocate(atomnum(n)) read(11,*)a(1:3) read(11,*)b(1:3) read(11,*)c(1:3) read(11,*)atomnum(1:n) read(11,*) do i=1,sum(atomnum(1:n))+1 read(11,*) enddo read(11,*)NGX,NGY,NGZ !compute angle call getmod(a,scale,amod) call getmod(b,scale,bmod) call getmod(c,scale,cmod) alpha=acos(dot_product(a,c)*(scale**2)/(amod*cmod))*180/3.1415926 beta=acos(dot_product(b,c)*(scale**2)/(bmod*cmod))*180/3.1415926 gamma=acos(dot_product(a,b)*(scale**2)/(amod*bmod))*180/3.1415926 !charge part open(12,file='ms.grd',status='replace') write(12,'(A)')"DMol3 spin density" write(12,'(A)')'(1p,e12.5)' write(12,'(6f8.3)')amod,bmod,cmod,alpha,beta,gamma write(12,'(3I5)')NGX-1,NGY-1,NGZ-1 write(12,'(7I5)')1,-(NGX/2-1),NGX/2,-(NGY/2-1),NGY/2,-(NGZ/2-1),NGZ/2 allocate(chgdata1(NGX,NGY,NGZ)) allocate(chgdata2(NGX,NGY,NGZ)) !--将电荷密度数据存入数组chgdata中---- read(11,*)chgdata1 do i=1,57 read(13,*) enddo read(13,*)chgdata2 !------------------------------------- VOL=scale*scale*scale*(a(1)*b(2)*c(3)+a(2)*b(3)*c(1)+a(3)*b(1)*c(2)& &-a(1)*b(3)*c(2)-a(2)*b(1)*c(3)-a(3)*b(2)*c(1)) write(*,*)VOL do i=1,NGZ do j=1,NGY do k=1,NGX write(12,'(6E12.5)')(chgdata1(k,j,i)-chgdata2(k,j,i))/VOL enddo enddo enddo write(*,*)"Write charge density successfully!!!" end subroutine |
3楼2011-10-22 23:23:51
hn19870519
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我对程序很无奈啊！我确实不会，希望大侠拯救一下下啊！！！ 5楼2011-10-23 11:39:06
6楼2011-10-23 11:42:42
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