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永峰1230

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[求助] blast 查询的问题已有1人参与

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi。。。。。http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome这两个网址为什么blast 结果不一样呢，，我该用哪个

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1楼2013-12-27 16:21:16

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Davidzjy

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【答案】应助回帖

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永峰1230: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢哦 2013-12-28 20:11:53
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-28 21:13:38

看你要用BLAST结果干什么
前者是genomic BLAST
比对的序列来自NCBI的基因组数据库
里面包含的每一条都是该物种的全基因组序列或者完整的WGS数据
后者是标准BLSATn
可以选择你需要的数据库(database一栏)
如nr/nt (non-redundant nucleotide) 是最大的核酸序列数据库
-----
所以还是要看你的需求是什么来选择合适的BLAST方式

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2楼2013-12-28 09:19:40

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