24小时热门版块排行榜

返回列表

purplesdd

金虫 (正式写手)

应助: 11 (小学生)
金币: 1080.9
散金: 91
红花: 11
帖子: 733
在线: 182.1小时
虫号: 1841261
注册: 2012-05-31
性别: MM
专业: 无机材料化学

[求助] 提交vasp的脚本是怎么写的呢？大家有没有模板让我学习一下呢已有2人参与

提交vasp的脚本是怎么写的呢？大家有没有模板让我学习一下呢，写好之后，提交任务的命令是qsub吗？因为之前提交MS的.pbs任务使用的是这个命令。。。希望得到您热心的帮助，我已经困惑已久了

2.png

回复此楼

» 猜你喜欢

回收溶剂求助已经有7人回复
职称评审没过，求安慰已经有40人回复
硝基苯如何除去已经有3人回复
A期刊撤稿已经有4人回复
垃圾破二本职称评审标准已经有17人回复
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿已经有22人回复
申请26博士已经有5人回复
EST投稿状态问题已经有7人回复
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦已经有4人回复
求助文献已经有3人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

最好的禅语是：该吃饭的时候好好吃饭，该睡觉的时候好好睡觉。

1楼 2013-12-15 22:31:28

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

490105179

木虫 (正式写手)

应助: 30 (小学生)
金币: 2860
散金: 3104
红花: 31
帖子: 801
在线: 331.1小时
虫号: 1773039
注册: 2012-04-23
性别: GG
专业: 材料物理化学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+5, 谢谢回帖交流 2013-12-16 22:07:12

不知道你用的是哪里的服务器，我的是深圳超算中心的，脚本如下：
#!/bin/sh
APP_NAME=intelg_mid
NP=12
NP_PER_NODE=12
RUN="RAW"
CURDIR=$PWD

VASP=~/bin/vasp.5.2.11-mp
source /home-gg/compiler/intel/composer_xe_2011_sp1/bin/compilervars.sh intel64
source /home-gg/compiler/mpi/openmpi-1.4.4-intel.sh

cd $CURDIR

#start creating .nodelist
rm -rf $CURDIR/nodelist >& /dev/null
for i in `echo $LSB_HOSTS`
do
echo "$i" >> $CURDIR/nodelist
done
nodelist=$(cat $CURDIR/nodelist | uniq | awk '{print $1}' | tr '\n' ',')

#
#
echo -n "start time  " > time
date >> time
mpirun -np $NP -machinefile $CURDIR/nodelist $VASP  &> vasp.out
echo -n "end time  " >> time ; date >> time
cat time >> vasp.out
#
#
exit

赞一下

回复此楼

2楼2013-12-16 10:05:28

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

purplesdd

金虫 (正式写手)

应助: 11 (小学生)
金币: 1080.9
散金: 91
红花: 11
帖子: 733
在线: 182.1小时
虫号: 1841261
注册: 2012-05-31
性别: MM
专业: 无机材料化学

引用回帖:

2楼: Originally posted by 490105179 at 2013-12-16 10:05:28
不知道你用的是哪里的服务器，我的是深圳超算中心的，脚本如下：
#!/bin/sh
APP_NAME=intelg_mid
NP=12
NP_PER_NODE=12
RUN="RAW"
CURDIR=$PWD

VASP=~/bin/vasp.5.2.11-mp
source /home-gg/com ...

谢谢您的帮助，我用的是PBS写的脚本，请问您使用什么写的？

赞一下

回复此楼

最好的禅语是：该吃饭的时候好好吃饭，该睡觉的时候好好睡觉。

3楼2013-12-16 19:35:07

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖