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小李爱学习

银虫 (正式写手)

[求助] 蛋白纯化后精二级质谱鉴定结果相差很远。 已有1人参与

我从芒果中分离纯化出了一个酸性蔗糖酶(Invertase),此酶经SDS分析显示是两条带(45k和55k)Native PAGE是一条带(145k)。将SDS胶和Native胶去做了蛋白质二级质谱鉴定,结果SDS 中45k的条带与数据库中能比对上的蛋白分数很低,只有12分,55k的分数特别高,500+,但并不是Invertase, Native胶的结果与55k的结果一致。我该怎么办?纯化过程中我都是按照蔗糖酶的活性收集的,为什么会是这种结果?求高人指点。
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
做MS鉴定前提条件是数据库里面有你的蛋白质的数据,换几个数据库看看
2楼2013-12-09 17:57:43
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johnny4890

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

那你的坚定结果是什么蛋白,会不会他们有共同水解的底物。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2014-03-09 01:00:20
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