应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » Illumina测序
81/1返回列表
查看: 1032  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

51jiankang

铜虫 (小有名气)

[求助] Illumina测序

请教各位虫友：我只是想大致检测下分离土壤中细菌的种类，有没有什么简单的方法？有人建议用Illumina测序，我想请问这样做得到的是什么结果？是每个细菌的16S rDNA序列吗？结果好分析吗？或者该怎么分析？谢谢！

[ Last edited by 51jiankang on 2013-12-4 at 11:15 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-12-04 10:39:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2013-12-04 12:53:03
51jiankang: 金币+5 2013-12-09 04:05:23
咦，看RSS是454的问题，进来就成illumina了。
做16S可以用illumina的MiSeq，最好是用V3试剂，测2*300bp。
得到序列结果呀，通过建库时添加的index序列就可以区分不同菌株。
赞一下 回复此楼
2楼2013-12-04 11:46:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
请问得到的是一个个的细菌序列吗？我只需要拿这些序列到NCBI网站上去做Blast就可以了吗？谢谢！
赞一下 回复此楼
3楼2013-12-04 12:31:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
51jiankang: 金币+5 2013-12-09 04:05:40
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-09 08:35:10
引用回帖:
3楼: Originally posted by 51jiankang at 2013-12-04 12:31:14
请问得到的是一个个的细菌序列吗？我只需要拿这些序列到NCBI网站上去做Blast就可以了吗？谢谢！

做二代测序，应该得有个服务器和懂生物信息的人吧。
一下子几个G甚至几十G上百G的数据出来，去NCBI做blast是不现实的。
赞一下 回复此楼
4楼2013-12-04 13:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-12-04 13:34:08
做二代测序，应该得有个服务器和懂生物信息的人吧。
一下子几个G甚至几十G上百G的数据出来，去NCBI做blast是不现实的。...

交给测序公司人做的，他们给顾客的是什么结果？
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-05 10:20:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
illumina的MiSeq测序跟454有什么区别啊？
赞一下 回复此楼
6楼2013-12-09 04:06:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
51jiankang: 金币+10 2013-12-09 13:30:41
51jiankang: 金币+30 2013-12-11 12:19:04
lz刚接触这一块吧，不要着急，慢慢就了解了。
测序公司给客户什么结果，这个我还真不知道，因为我没找过测序公司的。不过，我想应该是与收费高低有关吧，服务费越高，应该结果越详尽吧。至少 fastq文件应该是有的。
MiSeq和454的区别，这个题目太大了……测序原理，成本，读长，通量，都不同的呀，lz想知道啥呢？
赞一下 回复此楼
7楼2013-12-09 08:45:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-12-09 08:45:42
lz刚接触这一块吧，不要着急，慢慢就了解了。
测序公司给客户什么结果，这个我还真不知道，因为我没找过测序公司的。不过，我想应该是与收费高低有关吧，服务费越高，应该结果越详尽吧。至少 fastq文件应该是有的。 ...

是啊，以前没接触过MiSeq，测序公司推荐做这个，报价好几千呢，怕做不出结果，心虚啊
赞一下 回复此楼
8楼2013-12-09 13:30:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 51jiankang 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:23 by userper
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 300分，材料，求调剂，英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 305分求调剂（食品工程） +5 Sxy112 2026-03-21 7/350 2026-03-24 12:27 by 544594351
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭