应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » Illumina测序
81/1返回列表
查看: 1000  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

51jiankang

铜虫 (小有名气)

[求助] Illumina测序

请教各位虫友：我只是想大致检测下分离土壤中细菌的种类，有没有什么简单的方法？有人建议用Illumina测序，我想请问这样做得到的是什么结果？是每个细菌的16S rDNA序列吗？结果好分析吗？或者该怎么分析？谢谢！

[ Last edited by 51jiankang on 2013-12-4 at 11:15 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-12-04 10:39:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2013-12-04 12:53:03
51jiankang: 金币+5 2013-12-09 04:05:23
咦，看RSS是454的问题，进来就成illumina了。
做16S可以用illumina的MiSeq，最好是用V3试剂，测2*300bp。
得到序列结果呀，通过建库时添加的index序列就可以区分不同菌株。
赞一下 回复此楼
2楼2013-12-04 11:46:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
请问得到的是一个个的细菌序列吗？我只需要拿这些序列到NCBI网站上去做Blast就可以了吗？谢谢！
赞一下 回复此楼
3楼2013-12-04 12:31:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
51jiankang: 金币+5 2013-12-09 04:05:40
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-09 08:35:10
引用回帖:
3楼: Originally posted by 51jiankang at 2013-12-04 12:31:14
请问得到的是一个个的细菌序列吗？我只需要拿这些序列到NCBI网站上去做Blast就可以了吗？谢谢！

做二代测序，应该得有个服务器和懂生物信息的人吧。
一下子几个G甚至几十G上百G的数据出来，去NCBI做blast是不现实的。
赞一下 回复此楼
4楼2013-12-04 13:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-12-04 13:34:08
做二代测序，应该得有个服务器和懂生物信息的人吧。
一下子几个G甚至几十G上百G的数据出来，去NCBI做blast是不现实的。...

交给测序公司人做的，他们给顾客的是什么结果？
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-05 10:20:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
illumina的MiSeq测序跟454有什么区别啊？
赞一下 回复此楼
6楼2013-12-09 04:06:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
51jiankang: 金币+10 2013-12-09 13:30:41
51jiankang: 金币+30 2013-12-11 12:19:04
lz刚接触这一块吧，不要着急，慢慢就了解了。
测序公司给客户什么结果，这个我还真不知道，因为我没找过测序公司的。不过，我想应该是与收费高低有关吧，服务费越高，应该结果越详尽吧。至少 fastq文件应该是有的。
MiSeq和454的区别，这个题目太大了……测序原理，成本，读长，通量，都不同的呀，lz想知道啥呢？
赞一下 回复此楼
7楼2013-12-09 08:45:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

51jiankang

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-12-09 08:45:42
lz刚接触这一块吧，不要着急，慢慢就了解了。
测序公司给客户什么结果，这个我还真不知道，因为我没找过测序公司的。不过，我想应该是与收费高低有关吧，服务费越高，应该结果越详尽吧。至少 fastq文件应该是有的。 ...

是啊，以前没接触过MiSeq，测序公司推荐做这个，报价好几千呢，怕做不出结果，心虚啊
赞一下 回复此楼
8楼2013-12-09 13:30:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 51jiankang 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279求调剂 +3 dua1 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:23 by 大脸蛋子
[考研] 材料复试调剂 +3 学材料的点 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:07 by ccp273206157
[考研] 求调剂 +5 yunziaaaaa 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:57 by ccp273206157
[考研] 材料学硕318求调剂 +11 February_Feb 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:53 by ccp273206157
[考研] 材料化工调剂 +12 今夏不夏 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:32 by L135790
[考研] 0854复试调剂 276 +3 wmm9 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:13 by 热情沙漠
[考研] 材料类求调剂 +10 wana_kiko 2026-02-28 12/600 2026-03-01 22:10 by 海嵙Y
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +5 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:47 by 无际的草原
[考研] 材料学调剂 +9 提神豆沙包 2026-02-28 11/550 2026-03-01 18:15 by ms629
[考博] 26申博 +4 想申博！ 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博！
[考研] 290求调剂 +9 材料专硕调剂； 2026-02-28 11/550 2026-03-01 17:21 by sunny81
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-02-28 7/350 2026-03-01 15:14 by wjLi2017
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭