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谁来说说Illumina 、454 、ABI 测序的区别 已有6人参与
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同为高通量测序，来讨论讨论吧。 就用过454测土壤细菌多样性，后来听说Illumina数据量更大，只是读长短一些。 |
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kiruwa
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2楼2013-03-27 23:20:13
sadc
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3楼2013-03-28 07:18:13
4楼2013-03-28 09:24:10
sadc
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晕~ Illumina的、Roche的、ABI的，都是二代测序技术算是。 也有一些号称为三代测序的技术，比如Pacific Biosciences的什么。主要特征是单分子测序。 二代测序虽然快，但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性，做基因组没问题，但做转录组测序问题就有点突出了。 三代号称都是不需要扩增，样品量极少就可以直接测的，感觉更准一样的。但实现上现在有很多问题，还不成熟。主要就是错读率还是有点高。 Metagenome、转录组什么这些，这是这些高通量测序技术的应用而已。不管用什么高通量测序技术，几乎都可以做的。 |
5楼2013-03-28 21:19:05
gaoyang636
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6楼2013-08-19 16:53:56
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说得对。abi被life收购后，life又收购了Ion torrent 和proton。abi有自己的测序仪，叫ABI SOLiD se-quencer，用的人很少，看文章很少用这个来测得，life在不久前又被赛默飞收购了。从此以后测序巨头就是illumina，roche和life了。roche因为测序时间和通量的问题，已经宣布在2016年淘汰454测序了。 现在测序是一家独大：illumina。长度越来越长，q越来越高，时间越来越短，操作越来越简单，价格越来越低。现在不都号称是“一天一个基因组”，“一千美元成本费”。很多公司恶意收购illumina都没成功，包括roche，报价好几次都被拒绝了。 三代测序就是单分子测序。基本就是纳米孔测序进入市场了。 上面有人说“二代测序虽然快，但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性，做基因组没问题，但做转录组测序问题就有点突出了”，对我真的受益匪浅。谢谢谢谢 |
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