24小时热门版块排行榜    

查看: 4922  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sunjiankc

铁虫 (初入文坛)

[交流] 谁来说说Illumina 、454 、ABI 测序的区别 已有6人参与

同为高通量测序,来讨论讨论吧。
就用过454测土壤细菌多样性,后来听说Illumina数据量更大,只是读长短一些。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我个人认为 俗称的ABI,还是专指一代测序,那也是ABI最风光的年代。
后来变成了Life Technologies,之后才有了Ion torrent 和proton。
目前illumina的MiSeq 读长可以到2*300 bp, 大通量的HiSeq也能到2*150 bp。已经算很长的了。
6楼2013-08-19 16:53:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

kiruwa

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
现在ILLMUNINA赌场也跟上来了,454快被淘汰了, ABI就是sanger测序,第一代的测序技术,后者是next generation sequencing
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
2楼2013-03-27 23:20:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunjiankc

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sadc at 2013-03-28 07:18:13
ABI可能指的他收购的Ion Torrent。因为原理的问题,Ion Torrent错读的概率比Roche和Illumina的高出来一截。其他处理时间上面也没有什么优势,貌似感觉都快要消失了。...

意思是会马上被三代测序替代?就是那个megagenom?
4楼2013-03-28 09:24:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sadc

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by sunjiankc at 2013-03-28 09:24:10
意思是会马上被三代测序替代?就是那个megagenom?...

晕~
Illumina的、Roche的、ABI的,都是二代测序技术算是。
也有一些号称为三代测序的技术,比如Pacific Biosciences的什么。主要特征是单分子测序。
二代测序虽然快,但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性,做基因组没问题,但做转录组测序问题就有点突出了。
三代号称都是不需要扩增,样品量极少就可以直接测的,感觉更准一样的。但实现上现在有很多问题,还不成熟。主要就是错读率还是有点高。
Metagenome、转录组什么这些,这是这些高通量测序技术的应用而已。不管用什么高通量测序技术,几乎都可以做的。
5楼2013-03-28 21:19:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +8 炎黄贵胄 2026-08-22 9/450 2026-08-26 07:47 by WASM
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +21 羊腰板 2026-08-21 24/1200 2026-08-26 07:20 by finnigan
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 PbwVEMK5haaE 2026-08-25 6/300 2026-08-26 06:57 by cNXvBfCpiZOM
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 4/200 2026-08-26 02:04 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +18 angus9576 2026-08-25 22/1100 2026-08-26 00:41 by merchancy
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见