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sunjiankc

铁虫 (初入文坛)

[交流] 谁来说说Illumina 、454 、ABI 测序的区别 已有6人参与

同为高通量测序,来讨论讨论吧。
就用过454测土壤细菌多样性,后来听说Illumina数据量更大,只是读长短一些。
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sadc

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by sunjiankc at 2013-03-28 09:24:10
意思是会马上被三代测序替代?就是那个megagenom?...

晕~
Illumina的、Roche的、ABI的,都是二代测序技术算是。
也有一些号称为三代测序的技术,比如Pacific Biosciences的什么。主要特征是单分子测序。
二代测序虽然快,但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性,做基因组没问题,但做转录组测序问题就有点突出了。
三代号称都是不需要扩增,样品量极少就可以直接测的,感觉更准一样的。但实现上现在有很多问题,还不成熟。主要就是错读率还是有点高。
Metagenome、转录组什么这些,这是这些高通量测序技术的应用而已。不管用什么高通量测序技术,几乎都可以做的。
5楼2013-03-28 21:19:05
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
现在ILLMUNINA赌场也跟上来了,454快被淘汰了, ABI就是sanger测序,第一代的测序技术,后者是next generation sequencing
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
2楼2013-03-27 23:20:13
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sunjiankc

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sadc at 2013-03-28 07:18:13
ABI可能指的他收购的Ion Torrent。因为原理的问题,Ion Torrent错读的概率比Roche和Illumina的高出来一截。其他处理时间上面也没有什么优势,貌似感觉都快要消失了。...

意思是会马上被三代测序替代?就是那个megagenom?
4楼2013-03-28 09:24:10
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我个人认为 俗称的ABI,还是专指一代测序,那也是ABI最风光的年代。
后来变成了Life Technologies,之后才有了Ion torrent 和proton。
目前illumina的MiSeq 读长可以到2*300 bp, 大通量的HiSeq也能到2*150 bp。已经算很长的了。
6楼2013-08-19 16:53:56
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