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sunjiankc

铁虫 (初入文坛)

[交流] 谁来说说Illumina 、454 、ABI 测序的区别 已有6人参与

同为高通量测序,来讨论讨论吧。
就用过454测土壤细菌多样性,后来听说Illumina数据量更大,只是读长短一些。
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大爷给跪了

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-08-19 16:53:56
我个人认为 俗称的ABI,还是专指一代测序,那也是ABI最风光的年代。
后来变成了Life Technologies,之后才有了Ion torrent 和proton。
目前illumina的MiSeq 读长可以到2*300 bp, 大通量的HiSeq也能到2*150 bp。已 ...

说得对。abi被life收购后,life又收购了Ion torrent 和proton。abi有自己的测序仪,叫ABI SOLiD se-quencer,用的人很少,看文章很少用这个来测得,life在不久前又被赛默飞收购了。从此以后测序巨头就是illumina,roche和life了。roche因为测序时间和通量的问题,已经宣布在2016年淘汰454测序了。

现在测序是一家独大:illumina。长度越来越长,q越来越高,时间越来越短,操作越来越简单,价格越来越低。现在不都号称是“一天一个基因组”,“一千美元成本费”。很多公司恶意收购illumina都没成功,包括roche,报价好几次都被拒绝了。

三代测序就是单分子测序。基本就是纳米孔测序进入市场了。

上面有人说“二代测序虽然快,但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性,做基因组没问题,但做转录组测序问题就有点突出了”,对我真的受益匪浅。谢谢谢谢
7楼2014-05-14 11:14:07
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