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向NCBI提交序列,有没有片段长度限制?
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叮叮0504
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向NCBI提交序列,有没有片段长度限制?
向NCBI提交序列,有没有片段长度限制?
我做的是16Sv3区的DGGE,切胶后我没有做TA克隆,直接送出去测序,(因为我们的样品前期已经做过了16S克隆文库),测序结果和自己的文库相比,现在我想将测序的序列提交至NCBI,但是由于片段长度只有200bp左右,不知道这样的序列能不能提交至ncbi,求各位大虾帮忙解答,谢谢了!
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【求助/交流】请问,有没有谁知道,如何从NCBI上批量下载一类gene的核苷酸序列?
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如何向NCBI提交序列【已搜无重复】
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1楼
2013-12-02 14:40:36
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mirror3895
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不可以,NCBI已经不收这么短的序列了。你可以向EMBL提交,获得序列号。
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2楼
2013-12-03 09:36:27
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bikexmx
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应该是不行了,你可以提交试试,16S应该和其他基因不太一样,如果不行NCBI就会退回的,也没什么损失
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前方总有更多挑战,战胜恐惧,勇往向前,加油~~~~
3楼
2013-12-04 16:45:43
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yueyue月
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我做的也是16s V3区DGGE,得到的片段都不到200bp,但是用NCBI都提交上了,是10月的事,应该是可以的,提交的时候你好好的解释一下就凶行。
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4楼
2013-12-08 16:01:57
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yueyue月
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我做的也是16s V3区DGGE,最后测序得到的分子片段都不到200bp,用的就是NCBI提交的,最后都提交上了,就是10月份时候的事,你提交的时候和他们好好解释一下你序列的由来,是可以的。
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5楼
2013-12-08 16:04:25
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