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qureen

新虫 (初入文坛)

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[求助] 请教关于MEGA建NJ树问题？已有1人参与

我在NCBI上先下载了10个序列，建树后我所关注的物种和其他物种bootstrap value值还比较高，但我进行20个序列比对建树后，bootstrap value值降低很多，在NCBI上同源性都是76-95%左右的序列，这是怎么回事呢，各位大侠指点下啊！！

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1楼 2013-12-01 20:26:13

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lysnp

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

关于进化树的问题：我的一篇文章，审稿专家问“Although the FS and JL populations had the greatest genetic distance, in the UPGMA tree (Fig. 2) the YJ population is the most distant among the examined populations. The authors should explain why such a discrepancy occurs. To resolve the relationships among groups, NJ tree (neighbor-joining tree) might be an alternative to UPGMA. MEGA can produce also NJ tree. ”我该如何进行解释？

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