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ZOEY21金虫 (小有名气)
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用phylip建树如何设多个外群
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如题 我看有的文献做的树外群都有很多个的，那么请问 用phylip建立系统进化树如何设多个外群？还是只能设一个外群？还有我的树建好后用treeview查看都看不到自检值的？是树建的太差了吗？求大家帮忙啊 |
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 【分子生物】EPI帖 |
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rommel1941
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, MolEPI+1): 专业人士啊！ 2012-03-14 22:37:18
西瓜(金币+5, MolEPI+1): 专业人士啊！ 2012-03-14 22:37:18
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这个要看你研究的内容了，如果是近缘种之间的关系，不仅是NJ树，最好辅助以Bayes和ML树，这些都有对应的软件。或者使用MEGA也可以做初步的分析，只是发文章的时候效果不如其他专业软件来的有说服力。 关于外群的选择还是要针对情况，如果选的太远，内部分枝会很短，不利于讨论问题，太近的话可能无法有效分开，这还是基于你研究的问题而定。 得到树后，有很多软件可以辅助画树，如Figtree等。 希望对你有帮助，如果你在北京，我们可以当面联系，看看你的数据再说 |
4楼2012-03-14 22:26:07
rommel1941
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2楼2012-03-14 13:17:39
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3楼2012-03-14 17:24:50
