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cyxlcd

金虫 (小有名气)

[求助] SIESTA初安装,TEST出现问题

装上SIESTA3.1
进入TEST h2o文件夹
make
出现以下错误:
[root@localhost h2o]# ls
h2o.fdf  h2o.pseudos  makefile  siesta  work
[root@localhost h2o]# make
>>>> Running h2o test...
    ==> Copying pseudopotential file for H...
    ==> Copying pseudopotential file for O...
    ==> Running SIESTA as ../../../siesta
/bin/sh: ../../../siesta: No such file or directory
make: *** [completed_work] Error 127


请教大家,这是什么原因?
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

印象中3.1不是直接make,而是先要configure,貌似是在src的文件夹。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2013-11-28 18:03:03
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cyxlcd

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2013-11-28 18:03:03
印象中3.1不是直接make,而是先要configure,貌似是在src的文件夹。

谢谢回复,如何configure,可以说详细点吗?我初学这个,按照说明书上做的。
3楼2013-11-29 17:36:06
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★ ★ ★ ★
cyxlcd(ben_ladeng代发): 金币+6, 代楼主发放金币 2013-12-06 08:52:35
首先进入siesta的目录,cd ~/siesta

进入Src,cd Src

运行./configure,此时生成了arch.make

然后根据你的环境变量进行修改即可。vi arch.make

最后直接make就行了。
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4楼2013-11-29 23:40:12
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyxlcd at 2013-11-29 17:36:06
谢谢回复,如何configure,可以说详细点吗?我初学这个,按照说明书上做的。...

写错了,应该是先进入siesta/obj,然后../src/configure之后,修改arch.make,再make
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
5楼2013-11-30 00:04:10
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyxlcd at 2013-11-29 17:36:06
谢谢回复,如何configure,可以说详细点吗?我初学这个,按照说明书上做的。...

你可以详细看看/siesta/obj下面的README已经写的很清楚了
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6楼2013-11-30 00:06:46
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyxlcd at 2013-11-29 17:36:06
谢谢回复,如何configure,可以说详细点吗?我初学这个,按照说明书上做的。...

唉,太久不弄有点忘了,刚刚我自己重新编译了一下。我就再写一遍,上面的就别看了。
先是进入cd ~/siesta/obj
执行../Src/obj_setup.sh
执行../Src/configure
修改arch.make如数学库、MPI等
最后make
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2013-11-30 00:14:50
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cyxlcd

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡开发发 at 2013-11-30 00:14:50
唉,太久不弄有点忘了,刚刚我自己重新编译了一下。我就再写一遍,上面的就别看了。
先是进入cd ~/siesta/obj
执行../Src/obj_setup.sh
执行../Src/configure
修改arch.make如数学库、MPI等
最后make...

多谢你的详细回复,我之前是按照说明书上的的编译安装过:
../Src/obj_setup.sh
得到arch.make
make
然后出现了问题。
我看了你的回复,又按你的方法做了一遍,即:“先是进入cd ~/siesta/obj
执行../Src/obj_setup.sh
执行../Src/configure
最后make”然后回到test h2o文件夹中,仍然出现一样的问题。
我想是不是因为我没有修改arch.make文件?我现在只是初步安装,还没有涉及并行运算,所以我就没有更改这个文件。
请问你:只需串行的安装,需要如何修改arch.make?
非常感谢你的帮忙!
8楼2013-12-04 11:22:21
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
8楼: Originally posted by cyxlcd at 2013-12-04 11:22:21
多谢你的详细回复,我之前是按照说明书上的的编译安装过:
../Src/obj_setup.sh
得到arch.make
make
然后出现了问题。
我看了你的回复,又按你的方法做了一遍,即:“先是进入cd ~/siesta/obj
执行../Src/ob ...

只需要串行的话,编译器FC=gfortran,不要选择为mpif90,和MPI有关的lib都可以#掉。

你给出来的问题
root@localhost h2o]# make
>>>> Running h2o test...
    ==> Copying pseudopotential file for H...
    ==> Copying pseudopotential file for O...
    ==> Running SIESTA as ../../../siesta
/bin/sh: ../../../siesta: No such file or directory
make: *** [completed_work] Error 127
从情况上看,应该是test的时候脚本未找到你siesta程序的位置,我刚开始认为你编译可能没成功。你编译过程中make后是否报错?并且检查一下你编译出来siesta生成的位置。如果你的siesta位置不是h2o那个目录的../../../,那么你可以修改h2o下的那个makefile指明siesta的路径。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

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9楼2013-12-04 23:41:43
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cyxlcd

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2013-12-04 23:41:43
只需要串行的话,编译器FC=gfortran,不要选择为mpif90,和MPI有关的lib都可以#掉。

你给出来的问题
rootlocalhost h2o]# make
>>>> Running h2o test...
    ==> Copying pseudopotential f ...

非常感谢! 金币不知道怎么给.先送个红花。能弄清楚了再补上金币!
我明白问题出在哪里了!是路径!
我的makefile是:
“#
# Single-test makefile
#
name=h2o
#
include ../test.mk”
我不知道哪个地方改成siesta的路径,于是我把整个文件夹"h2o"换了一个位置,然后发现make成功了!
于是问题变成了:如何在不改文件夹路径而是改makefile的siesta路径,能make成功?
10楼2013-12-05 16:51:22
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